次世代シーケンスを用いた新規貪食シグナル因子の同定

Material type: 文書・図像類

Author: 戸田, 聡ほか

Publisher: 金沢大学新学術創成研究機構ナノ生命科学研究所 / 京都大学

Publication date: 2015-09-25

Material Format: Digital

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Note (General)：: マクロファージは、死細胞や赤血球が排出した核の表面に露出されるホスファチジルセリンを認識し、それらを貪食する。本研究は、貪食を促進する因子を同定するため、次世代シーケンスを用いた貪食能の機能スクリーニング法を樹立することを目的とした。死細胞の貪食能のない浮遊系細胞株Ba/F3に、腹腔の常在マクロファ...

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Material Type: 文書・図像類
Title: 次世代シーケンスを用いた新規貪食シグナル因子の同定
Author/Editor: 戸田, 聡
Toda, Satoshi
Author Heading: 戸田, 聡
Toda, Satoshi
Publication, Distribution, etc.: 金沢大学新学術創成研究機構ナノ生命科学研究所 / 京都大学
Publication Date: 2015-09-25
Publication Date (W3CDTF): 2015-09-25
Alternative Title: Fuctional screening for engulfment of apoptotic cells with next generation sequence
Periodical title: 平成26(2014)年度科学研究費補助金研究活動スタート支援研究成果報告書 = 2014 Fiscal Year Final Research Report
No. or year of volume/issue: 2014-08-29 - 2015-03-31
Volume: 2014-08-29 - 2015-03-31
Pages: 4p.-
Text Language Code: jpn
Subject Heading: 貪食
マクロファージ
アポトーシス
Target Audience: 一般
Note (General): マクロファージは、死細胞や赤血球が排出した核の表面に露出されるホスファチジルセリンを認識し、それらを貪食する。本研究は、貪食を促進する因子を同定するため、次世代シーケンスを用いた貪食能の機能スクリーニング法を樹立することを目的とした。死細胞の貪食能のない浮遊系細胞株Ba/F3に、腹腔の常在マクロファージから調製したcDNAライブラリーを導入し、死細胞を貪食したBa/F3細胞をソーティングすることを繰り返した。その結果、貪食能を獲得したBa/F3細胞が濃縮され、次世代シーケンスを使ってその細胞集団に導入されたcDNAを網羅的に調べたところ、貪食に関与する因子が複数検出された。
Macrophages recognize phosphatidylserine exposed on apoptotic cells and nuclei expelled from erythroblasts to engulf them. To identify factors that promote the engulfment, I aim to establish a functional screening system for engulfment of apoptotic cells with next generation sequence. I introduced cDNA library of resident peritoneal macrophages into a suspension cell line, Ba/F3, which has no ability to engulf apoptotic cells. Then I sorted Ba/F3 cells which engulfed apoptotic cells. Ba/F3 cells which acquired engulfment ability were enriched and I read cDNA sequences integrated in the cells with next generation sequence. As a result, several genes which have an ability to promote engulfment of apoptotic cells were detected.
研究課題/領域番号:26893120, 研究期間(年度):2014-08-29 - 2015-03-31
出典：研究課題「次世代シーケンスを用いた新規貪食シグナル因子の同定」課題番号26893120（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-26893120/26893120seika/)を加工して作成
DOI: 10.24517/00056705
Source: https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=50396&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=50396&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
Access Restrictions: 限定公開
Rights (production): CC BY-NC-ND
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https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26893120/
https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-26893120/26893120seika/
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 金沢大学 : 金沢大学学術情報リポジトリKURA