A New Implicit Solvent Model for Brownian Dynamics Simulation: Solvent-Accessible Surface Area Dependent Effective Charge Model

• 資料種別: 記事
• タイトル: A New Implicit Solvent Model for Brownian Dynamics Simulation: Solvent-Accessible Surface Area Dependent Effective Charge Model
• 著者・編者: 安藤 格士; 目黒 俊幸; 山登 一郎
• 著者標目: 安藤 格士; 目黒 俊幸; 山登 一郎
• 並列タイトル等: ブラウン動力学シミュレーションのための新規溶媒効果モデル:露出表面積依存型有効電荷モデル
• タイトル（掲載誌）: Journal of computer chemistry, Japan
• 巻号年月日等（掲載誌）: 3(4) 2004.12
• 掲載巻: 3
• 掲載号: 4
• 掲載ページ: 129～136
• 掲載年月日（W3CDTF）: 2004-12
• ISSN（掲載誌）: 1347-1767
• ISSN-L（掲載誌）: 1347-1767
• 出版事項（掲載誌）: 東京 : 日本コンピュータ化学会
• 出版地（国名コード）: JP
• 本文の言語コード: eng
• 件名標目: Solvent-accessible surface area model; Distance-dependent dielectric model; Generalized Born model; ブラウン動力学法; Effectivechargeモデル; Solvent-accessiblesurfaceareaモデル; Distance-dependentdielectricモデル; GeneralizedBornモデル
• NDLC: ZP1
• 対象利用者: 一般
• コレクション（個別）: 国立国会図書館デジタルコレクション > 電子書籍・電子雑誌 > 学術機関 > 学協会; https://dl.ndl.go.jp/collections/B00043
• オンライン閲覧公開範囲: インターネット公開
• 遠隔複写可否（NDL）: 不可
• 所蔵機関: 国立国会図書館
• 請求記号: Z74-C857
• 関連情報（URI）: http://dl.ndl.go.jp/info:ndljp/pid/9623939
• 関連情報（国立国会図書館永続的識別子）: info:ndljp/pid/9623939; http://dl.ndl.go.jp/info:ndljp/pid/9623939
• 連携機関・データベース: 国立国会図書館 : 国立国会図書館雑誌記事索引; https://ndlsearch.ndl.go.jp
• 書誌ID（NDLBibID）: 7194700; http://id.ndl.go.jp/bib/7194700
• 整理区分コード: 632

• 要約等: 新規溶媒効果モデルである有効電荷（Effective Charge; EC）モデルを開発し、AMBERユナイテッド・アトムモデルを用いたブラウン動力学法に導入した。ECモデルでは個々の原子の電荷はその露出表面積に比例して減衰するものとした（Eq. 2）。本ECモデルの有効性を検証するため、ββα構造...