α-アミノニトリルジアステレオマーの配座解析(特集 計算化学アプリケーションによる生命・物質科学の探求)

• 資料種別: 記事
• タイトル: α-アミノニトリルジアステレオマーの配座解析
• 著者・編者: 櫻井 ルミ子; 内田 朗; 服部 徹太郎 他
• シリーズタイトル: 特集 計算化学アプリケーションによる生命・物質科学の探求
• 著者標目: 櫻井 ルミ子; 内田 朗; 服部 徹太郎
• 並列タイトル等: Conformational analysis of diastereomeric α-amino nitriles
• タイトル（掲載誌）: Journal of computer chemistry, Japan
• 巻号年月日等（掲載誌）: 7(4・5) 2008.12
• 掲載巻: 7
• 掲載号: 4・5
• 掲載ページ: 117～123
• 掲載年月日（W3CDTF）: 2008-12
• ISSN（掲載誌）: 1347-1767
• ISSN-L（掲載誌）: 1347-1767
• 出版事項（掲載誌）: 東京 : 日本コンピュータ化学会
• 出版地（国名コード）: JP
• 本文の言語コード: jpn
• 件名標目: Conformation analysis; Crystal structure; Packing force; Hydrogen bond
• NDLC: ZP1
• 対象利用者: 一般
• 所蔵機関: 国立国会図書館
• 請求記号: Z74-C857
• 連携機関・データベース: 国立国会図書館 : 国立国会図書館雑誌記事索引; https://ndlsearch.ndl.go.jp
• 書誌ID（NDLBibID）: 9784100; http://id.ndl.go.jp/bib/9784100
• 整理区分コード: 632

• 要約等: ジアステレオマーの関係にある2つのα-アミノニトリル[1<I>S</I>,2<I>R</I>,(<I>S</I>)]-および[1<I>S</I>,2<I>R</I>,(<I>R</I>)]-<I>N</I>-シアノフェニルメチル-1-アミノインダン-2-オール［(<I>S</I>)-<B>1</B>および(<I>R</I>)-<B>1</B>］の配座解析をDFT B3LYP/6-31G*レベルで行った．その結果，両ジアステレオマーは，配座異性体の混合物として存在することがわかった．(<I>S</I>)-<B>1</B>では，エネルギー最小配座 <B>S1</B>から0.4 kcal/molのエネルギー幅に2つの安定配座 <B>S2</B>, <B>S3</B>があり，占有率はそれぞれ43% (<B>S1</B>), 24% (<B>S2</B>), 22% (<B>S3</B>)であった（Table 1）．これに対して，(<I>R</I>)-<B>1</B>では，エネルギー最小配座 <B>R1</B>が他の配座に比べて1.51 kcal/mol以上安定であり，全体の76%を占めた（Table 2）．また，両ジアステレオマーのエネルギー差は小さく（Δ<I>E</I> = –0.09 kcal/mol），このことは，2つのジアステレオマーがDMSO中で50:50の平衡組成になるという観察結果と良く符合した．一方，結晶中では，(<I>S</I>)-<B>1</B>が(<I>R</I>)-<B>1</B>よりも安定なことがわかっている．X線結晶構造解析で得られた(<I>S</I>)-<B>1</B>の配座 <B>S0</B>は <B>S3</B>と良く一致する（Figure 1, Table 3）．また，結晶中では，1分子が隣接する4分子と水素結合を形成している（Figure 2<I>b</I>）．さらに，結晶密度は(<I>R</I>)-<B>1</B>よりも(<I>S</I>)-<B>1</B>の方が高い．これらのことから，(<I>S</I>)-<B>1</B>では，<B>S3</B>が密に充填し，分子間水素結合も手伝って，安定な結晶を形成していると考えられる．他方，(<I>R</I>)-<B>1</B>では，結晶中の配座 <B>R0</B>は <B>R1</B>とフェニル基の配座と水素結合に違いが見られる（Figure 1, Table 3）．結晶密度も低いことから，<B>R1</B>はそのままでは結晶化が困難で，配座と水素結合を変化させて，安定性の低い結晶を形成していると考えられる．
• DOI: 10.2477/jccj.h2012; https://doi.org/10.2477/jccj.h2012
• オンライン閲覧公開範囲: インターネット公開
• 関連情報（URI）: http://id.ndl.go.jp/bib/9784100; https://ndlsearch.ndl.go.jp/books/R000000004-I9784100; https://www.jstage.jst.go.jp/article/jccj/7/4/7_H2012/_pdf
• 参照: Molecular Mechanisms of Dielectrically Controlled Resolution (DCR); https://cir.nii.ac.jp/crid/1360011144720410624; Preferential Crystallization; https://cir.nii.ac.jp/crid/1360011145166493184; Dutch Resolution of Racemates and the Roles of Solid Solution Formation and Nucleation Inhibition; https://cir.nii.ac.jp/crid/1360011145713457024; Epimerization of Diastereomeric α-Amino Nitriles to Single Stereoisomers in the Solid State; https://cir.nii.ac.jp/crid/1360574093538076288; Solid-State Induced Control of Kinetically Unstable Stereoisomers; https://cir.nii.ac.jp/crid/1360574094536275968; Photosensitized 2 + 2 Cycloaddition Reaction Using Homochirality Generated by Spontaneous Crystallization; https://cir.nii.ac.jp/crid/1361137043686868736; Solvent-Free Organic Synthesis; https://cir.nii.ac.jp/crid/1361418519608533760; The Combination of Spontaneous Resolution and Asymmetric Catalysis: A Model for the Generation of Optical Activity from a Fully Racemic System; https://cir.nii.ac.jp/crid/1361418520265668480; Racemic [1SR,2RS,(RS)]-N-cyano(phenyl)methyl-1-aminoindan-2-ol: crystal structure and reactivity towards thermal epimerization in the solid state; https://cir.nii.ac.jp/crid/1361699994897042048; Catalytic Enantioselective Strecker Reactions and Analogous Syntheses; https://cir.nii.ac.jp/crid/1361981470195109504; Crystallization-induced asymmetric transformation: stereospecific synthesis of a potent peripheral CCK antagonist; https://cir.nii.ac.jp/crid/1363388843230344576; Macromodel—an integrated software system for modeling organic and bioorganic molecules using molecular mechanics; https://cir.nii.ac.jp/crid/1363388845339339520; Mechanism and Scope of Preferential Enrichment, a Symmetry-Breaking Enantiomeric Resolution Phenomenon; https://cir.nii.ac.jp/crid/1363670318387921920; Crystallization-Induced Diastereomer Transformations; https://cir.nii.ac.jp/crid/1364233270260580096
• 連携機関・データベース: 国立情報学研究所 : CiNii Research; https://cir.nii.ac.jp/
• 提供元機関・データベース: Japan Link Center; https://japanlinkcenter.org/top; 雑誌記事索引データベース; https://ndlsearch.ndl.go.jp; Crossref; https://www.crossref.org; CiNii Articles; 科学研究費助成事業データベース; https://kaken.nii.ac.jp/ja
• 書誌ID（NDLBibID）: 9784100; http://id.ndl.go.jp/bib/9784100
• NII論文ID: 10023985793