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微細藻類によるオメガ3脂肪酸の効率的生産に向けた人工染色体の構築

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微細藻類によるオメガ3脂肪酸の効率的生産に向けた人工染色体の構築

資料種別
図書
著者
前田 義昌
出版者
-
出版年
2023
資料形態
デジタル
ページ数・大きさ等
-
NDC
-
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資料に関する注記

一般注記:

本研究では、珪藻の染色体複製・分配に関わる自立複製配列とセントロメアを特定し、多数の遺伝子を一括導入可能な人工染色体ベクターを開発することで、ω3脂肪酸の生産効率の飛躍的向上を目指した。まず海洋珪藻の染色体レベルにアセンブルしたゲノムデータから、GC含量に関する特徴量を基にセントロメア領域を推定し、...

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書誌情報

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デジタル

資料種別
図書
著者・編者
前田 義昌
出版年月日等
2023
出版年(W3CDTF)
2023
並列タイトル等
Development of artificial chromosomes for efficient production of omega 3 fatty acids in microalgae
本文の言語コード
jpn
件名標目
対象利用者
一般
一般注記
本研究では、珪藻の染色体複製・分配に関わる自立複製配列とセントロメアを特定し、多数の遺伝子を一括導入可能な人工染色体ベクターを開発することで、ω3脂肪酸の生産効率の飛躍的向上を目指した。まず海洋珪藻の染色体レベルにアセンブルしたゲノムデータから、GC含量に関する特徴量を基にセントロメア領域を推定し、ベクターの接合伝達法と組み合わせて、その機能評価を行った。接合伝達法によりω3脂肪酸合成酵素遺伝子を珪藻に導入し、ω3脂肪酸代謝経路の拡張にも成功した。さらに、ChIP-Seq法に基づいて自立複製配列を特定した。本研究は、微細藻類において自立複製配列を実験的に特定した初めての研究である。
In this study, we aimed to improve the productivity of omega-3 fatty acids by development of artificial chromosomes on which the microalgal centromere and autonomous replication sequence are introduced. First, we estimated the centromeres from the chromosome-level assembly data of diatom genome using the parameter related to GC content. The function of the estimated centromeres was investigated with the aid of bacterial conjugation technique. We successfully demonstrated the expansion of the metabolic pathway for biosynthesis of omega-3 fatty acids. Furthermore, the autonomous replication sequences were identified with the chromatin immunoprecipitation-sequencing (ChIP-Seq) technique. This is, to the best of our knowledge, the first study to identify the autonomous replication sequences by experimental investigation.
科学研究費助成事業 研究成果報告書:基盤研究(C)2021-2023 課題番号 : 21K04784
記録形式(IMT)
application/pdf
オンライン閲覧公開範囲
インターネット公開
連携機関・データベース
国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース(IRDB)(機関リポジトリ)
提供元機関・データベース
筑波大学 : つくばリポジトリ