並列タイトル等Musashi1-RNA ソウゴ サヨウ ゲノム マッピング
Musashi1-RNA sogo sayo genomu mappingu
Genome-wide mapping of Musashi1-RNA interaction
一般注記type:text
in vivo蛋白質-RNA相互作用検出法、HITS-CLIPにより、神経幹細胞に強く発現するRNA結合蛋白質Musashi1(Msi1)の胎生期マウス脳におけるMsi1-RNA相互作用のゲノムマッピングを行った。その結果、生体内におけるMsi1のRNA結合部位をゲノムワイド1塩基解像度で同定することに成功した。このMsi1-RNA相互作用ゲノムマップを用いる事で、新規のMsi1標的RNA遺伝子群を同定し、これまでの解析で明らかとなっていたMsi1のRNA制御に加え、新たに新規のMsi1の機能の発見を導く事ができた。
To understand a comprehensive role of neural RNA binding protein, Msi1, which is expressed in neural stem cells, we generated genome-wide Msi1-RNA binding map on the mouse embryonic brain by using HITS-CLIP, High-throughput sequencing of RNA isolated by crosslinking immunoprecipitation methods. By using Msi1-RNA interaction map, we identified robust Msi1 RNA binding regions transcribed from the genome, specific in vivo RNA motif at the 1nt resolution, identified by CIMS assay and many novel RNA targets of Msi1. In addition to previously known Msi1 function, we found the novel functions of Msi1 in various aspects of RNA processing, validated in null mutant mice and gain of function study.
研究種目 : 若手研究(B)
研究期間 : 2012～2013
課題番号 : 24700333
研究分野 : 総合領域
科研費の分科・細目 : 脳神経科学・神経科学一般
一次資料へのリンクURLhttps://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_24700333seika
連携機関・データベース国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）