並列タイトル等タンイツ サイボウ カイセキ ノ タメ ノ, ゼンゲノム ゾウフク ギジュツ ノ サイテキカ ノ ケンキュウ
Tan'itsu saibō kaiseki no tame no, zengenomu zōfuku gijutsu no saitekika no kenkyū
Optimization of whole genome amplification methods for single cell analysis
一般注記type:text
着床前遺伝子診断の実際では, 稀少なDNA量の遺伝子増幅の際に, 例えば対立アリルの一方のみが増幅されないアレルドロップアウト現象の出現が知られ, 誤診断の原因となる. 現在までに利用可能な各種全ゲノム増幅技術 (WGA) を比較した. その結果, WGAの違いによって, 検出されやすい遺伝子変異が異なる事象が観察された. また, WGA毎に増幅されやすい遺伝子領域が異なり, それは, 同一の遺伝子領域においてさえも, 増幅のバイアスは観察された. いずれのWGAを採用しても, あらゆる遺伝子においてADOは観察される結果を得た. 現時点では, MDA法が最も汎用性が高い.
It is known that the allele dropout phenomenon, in which only one of the alleles is not amplified, occurs in the process of genome amplification from scarce amount of DNA and causes a misdiagnosis. We compared various whole genome amplification techniques (WGA) available. We observed that the mutations detected differed depending on the each WGA methods. Amplification bias was observed even in the same gene region. ADO was observed at any locus regardless of which WGA was adopted. At present, the MDA method is the most versatile.
研究種目 : 基盤研究 (C) (一般)
研究期間 : 2016~2019
課題番号 : 16K11106
研究分野 : 生殖医学
連携機関・データベース国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース(IRDB)(機関リポジトリ)