脳腫瘍クリニカルシークエンスの基盤作成

• 資料種別: 文書・図像類
• タイトル: 脳腫瘍クリニカルシークエンスの基盤作成
• 著者・編者: 西原, 広史
• 著者標目: 西原, 広史
• 出版年月日等: 2019
• 出版年（W3CDTF）: 2019
• 並列タイトル等: ノウシュヨウ クリニカル シークエンス ノ キバン サクセイ; Nōshuyō kurinikaru shīkuensu no kiban sakusei; Clinical sequence platform for brain tumor
• タイトル（掲載誌）: 科学研究費補助金研究成果報告書
• 本文の言語コード: jpn; eng
• 件名標目: 脳腫瘍,クリニカルシーケンス,ゲノム解析,個別化診断,がんゲノム医療,次世代シーケンサー,分子病理
• 対象利用者: 一般
• 一般注記: type:text; 本研究では、以下の3つのテーマについて、それぞれ研究成果を得た。1) クリニカルシークエンスのための脳腫瘍検体の処理、保管方法の検証⇒DIN3.0以上でシーケンス成功率100％という品質管理基準の設定に成功 2) 神経膠腫の標的遺伝子パネルの選定と、LOH検出方法の確立⇒Target amplicon sequenceにて1p19q codeletionの検出が可能なCN計測アルゴリズムの作製に成功 3) 診療情報との統合解析によるクリニカルシークエンス解析パイプラインの構築⇒ PleSSisionシステムの開発に成功 研究目的は100％達成することができた。 We performed 3 themes of research. 1) Sequence quality parameter : DIN value over 3.0 is the critical cut off for successful clinical sequence. 2) CN detection algorithm: We have developed original pipeline which enable us to detect 1p19q codeletion in glioma using even amplicon target sequence. 3) Clinical sequence pipeline integrated clinical information: We have ranched original clinical sequence system "PleSSision" which are already installed in more than 25 hospitals in Japan. We have achieved initial goals in almost 100 %.; 研究種目 : 基盤研究 (C) (一般) 研究期間 : 2017～2019 課題番号 : 17K10855 研究分野 : ゲノム病理学
• オンライン閲覧公開範囲: 限定公開
• 関連情報: 科研費研究者番号 : 50322805
• 連携機関・データベース: 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）; https://irdb.nii.ac.jp
• 提供元機関・データベース: 慶應義塾大学 : 慶應義塾大学学術情報リポジトリ