並列タイトル等Classification of the cell hierarchy structure by single cell transcriptome
タイトル(掲載誌)平成27(2015)年度 科学研究費補助金 基盤研究(B) 研究成果報告書 = 2015 Fiscal Year Final Research Report
一般注記金沢大学医薬保健学総合研究科
細胞集団の1細胞ずつの性格を明らかにし、真の細胞状態を把握することは生物学の研究にとって非常に重要である。本研究では微量/1細胞トランスクリプトーム解析法を開発し、がん細胞や免疫細胞の細胞集団の階層性を明らかにし、真の細胞状態を把握することで将来的に臨床研究に役立てることを目的とする。本研究では単一細胞遺伝子発現解析の発展系として数百以上の1細胞の遺伝子発現を同時に観察出来る革新的な技術(Nx1-seq)を開発した。この方法を用いて新たにがん細胞株、免疫細胞の1細胞遺伝子解析を行い有用性を確認した。
A tissue, an organ, or even a differentiated state of cells are composed of heterogeneous cell populations. Single-cell gene-expression profiling allows you to identify and characterize various types of each cell. Here, we have developed the novel strategy (Nx1-seq) of single-cell transcriptome analysis for thousands of single cells. In our approach, single cells are deposited in a high-density microwell plate and lysed in situ. mRNA is then captured on barcoding microbeads developed by emulsion PCR and reverse transcribed. By applying this Nx1seq method for thousands of cells per experiment, we have successfully characterized 1) complex heterogeneous types of cells in the human endometrioid adenocarcinoma cancer cell line and 2) immune cells at a certain differentiated state.
研究課題/領域番号:25290071, 研究期間(年度):2013-04-01 - 2016-03-31
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https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25290071/
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