並列タイトル等Development of microbial detection tool for link between phylogeny and function
タイトル(掲載誌)平成29(2017)年度 科学研究費補助金 挑戦的萌芽研究 研究成果報告書 = 2017 Fiscal Year Final Research Report
一般注記金沢大学理工研究域地球社会基盤学系
本研究では、未培養微生物群の16S rRNA遺伝子と機能遺伝子を簡便かつハイスループッドに両者をリンクづけて解析する技術を創成することを目的とした。まず、純粋細菌のゲノムDNAを用いて、申請者の研究アイディアの実証を行なった。その結果、微生物ゲノムから2種類の遺伝子を結合することが可能であった。次に、純粋細菌の細胞を用いて実施したところ、ゲノムを用いた時と実験条件は異なるものの、2種類の遺伝子結合が可能であった。シークエンス解析の結果からも、2種類の遺伝子配列が結合していることが確認できた。
We demonstrated the idea for link between 16S rRNA gene and functional gene. The two genes were combined from the microbial genome/cell by fusion PCR. However we found that PCR condition is little bit different with the microbial genome and the cell. Sequencing result showed that two genes were combined correctly.
研究課題/領域番号:16K14799, 研究期間(年度):2016-04-01 - 2018-03-31
出典:研究課題「未培養微生物群の生理学的機能と系統分類を網羅的に結ぶ新規技術の創成」課題番号16K14799(KAKEN:科学研究費助成事業データベース(国立情報学研究所)) (https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-16K14799/16K14799seika/)を加工して作成
一次資料へのリンクURLhttps://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=46428&item_no=1&attribute_id=26&file_no=2
関連情報https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=90771585
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16K14799/
https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-16K14799/16K14799seika/
連携機関・データベース国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース(IRDB)(機関リポジトリ)