並列タイトル等Elucidation of evolution toward land plants based on genome sequene of every charophycean order
タイトル(掲載誌)令和1(2019)年度 科学研究費補助金 基盤研究(B) 研究成果報告書 = 2019 Fiscal Year Final Research Report
一般注記シャジクモの概要ゲノムとクレブソルミディウム、陸上植物などの比較で、シャジクモ以前に獲得された遺伝子、シャジクモと陸上植物の分岐以降に陸上植物の系統で獲得された遺伝子、シャジクモの系統で独自に増加した遺伝子を区別できるようになった。さらに、広義のシャジクモ藻綱の藻類(ストレプトファイツ藻類)のゲノム解読がすすみ、コレオケーテ以外の主要な系統すべてについて、概要ゲノムにアクセスできるようになった。コレオケーテについては次世代シーケンサーによるcDNA配列大量決定を行い発現している遺伝子はアクセスできるようになった。
Comparison of Chara braunii draft genome and Klebosrmidum nitens, land plant genomes clarified which gene are present before the divergence of Charophyceae and land plants and lineage specific gain/expansion in each of Charophyceae and land plant lineages.Further, with the progress of genome sequencing, draft genomes of all major phyla except Coleochaetophyceae have become available. For Coleochaete, RNA-seq analyses have been done and most of expressed gene sequence data are made accessible.
研究課題/領域番号:15H04413, 研究期間(年度):2015-04-01 - 2020-03-31
出典:「シャジクモ藻綱全目ゲノム解読にもとづく陸上植物への進化解明」研究成果報告書 課題番号15H04413(KAKEN:科学研究費助成事業データベース(国立情報学研究所)) (https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-15H04413/15H04413seika/)を加工して作成
一次資料へのリンクURLhttps://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=51673&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
関連情報https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=50390688
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15H04413/
https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-15H04413/15H04413seika/
連携機関・データベース国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース(IRDB)(機関リポジトリ)