並列タイトル等Thermodynamic study of RNA trinucleotide recognition within silica mesopores
一般注記application/pdf
研究報告書
研究成果の概要（和文）： 本研究では，リボソームなどで見られる3塩基認識の詳細解明を目的として，メソポーラスシリカが持つ均一メソ細孔空間を反応場とする実験系を構築し，以下の研究課題を遂行した。(1) 細孔内過冷却水を利用した短鎖DNA二重鎖の構造安定性評価：シリカメソ細孔内では3塩基認識が効率的に進行することを見いだした。(2) ループ構造を持つヘアピンループ構造の細孔内安定性：ループ部位のわずかな構造変化によって構造安定性が細孔内で低下することを見いだした。(3) 短鎖DNA二重鎖の安定性におよぼす空隙サイズの
影響：サイズマッチングによる飛躍的な構造安定化を定量的に評価した。研究成果の概要（英文）：In the present study, we aimed to clarify trinucleotide recognition process occurred inside meso-sized cavities of mesoporous silica. As the results, we found following three characteristics in the trinucleotide recognition: (1) efficient duplex formation of short (3- and 4-mer) DNA fragments could be achieved inside silica mesopores under cryogenic conditions, (2) DNA hairpin structure, on the other hand, was destabilized by the confinement inside the mesopores, (3) the duplex stability was significantly enhanced by size-matching between the pore size and the duplex width.
連携機関・データベース国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）