イネ人工染色体を用いた多色FISH法によるイネ科穀類の染色体彩色とシンテニー解析

Material type: 文書・図像類

Author: 向井, 康比己

Publisher: -

Publication date: 2000-03

Material Format: Paper

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Note (General)：: type:Working Paper1.イネまたはタルホコムギのバクテリア人工染色体(BAC)クローンを染色体別にプールしてプローブとして、タルホコムギやパンコムギなどのイネ科穀類の染色休に対して、多色FISH法で染色体ペインティング(彩色)を行った。3種類の蛍光色素を組み合わせることによって、各染...

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Material Type: 文書・図像類
Title: イネ人工染色体を用いた多色FISH法によるイネ科穀類の染色体彩色とシンテニー解析
Author/Editor: 向井, 康比己
Author Heading: 向井, 康比己
Publication Date: 2000-03
Publication Date (W3CDTF): 2000-03
Alternative Title: 平成9年度～平成11年度科学研究費補助金(基盤研究(B))研究成果報告書
Text Language Code: eng
Subject Heading: イネ科穀類
タルホコムギ
バクテリア人工染色体(BAC)
多色FISH法
染色体彩色
シンテニー解析
セントロメア
DNAファイバーFISH
Target Audience: 一般
Note (General): type:Working Paper
1.イネまたはタルホコムギのバクテリア人工染色体(BAC)クローンを染色体別にプールしてプローブとして、タルホコムギやパンコムギなどのイネ科穀類の染色休に対して、多色FISH法で染色体ペインティング(彩色)を行った。3種類の蛍光色素を組み合わせることによって、各染色体由来のプローブを異なった色ですべてを区別するような標識-検出系のシステムの開発に成功した。また。この染色体彩色の技術によって、イネ科穀類の1つであるシコクビエあるいはピーナッツやコーヒーなどの4倍性有用植物ののゲノム提供種を同定することができた。2.タルホコムギのBACライブラリーから500クローン(一部は各種病虫害低抗性遺伝子、種子貯蔵蛋白質遺伝子、澱粉生合成系遺伝子などの有用遺伝子を含む)選び、コムギおよび他の穀類の中期染色体に多色FISHを行い、染色体上のシグナルの位置からシンテニー解析を行った。重要遺伝子の多くは、染色体の末端にマップされ、タンデムに重複して存在していることがわかった。また、一部の遺伝子では種を超えて、シンテニーが保存されていた。3.イネ科穀類のDNAファイバーにタルホコムギ由来の人工染色体(BAC)クローンを位置付ける方法を開発した。これによって、コンティグ作成の可視化が可能となった。4.セントロメア領域を含むタルホコムギのBACクローンを多数単離することができ、これらクローンの詳細な解析を行ったところ、イネ、ソルガム、オオムギ、トウモロコシで報告されたセントロメア配列とホモロジーをもつ配列がみつかった。また、BACクローンやサブクローンされたものを用いてイネ科穀類の染色体にFISHを行った。さらに、DNAファイバーFISHによって各種セントロメア配列の構造を明らかにした。
Related Material (NCID): BA48791893
https://ci.nii.ac.jp/ncid/BA48791893
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 大阪教育大学 : 大阪教育大学リポジトリ