マイクロRNAを介したシグナル伝達機構のシステム解析

Material type: 文書・図像類

Author: 篠田, 幸作

Publisher: -

Publication date: 2011

Material Format: Digital

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Note (General)：: type:textmicroRNA(miRNA)は、内在性のnon-coding RNAであり、標的となる遺伝子の翻訳を制御する。現在、miRNAの役割は、coding RNAを『fine-scale-adjustment(微調整)』する点にあるとされている( Baek et al., Nature...

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科研費研究者番号 : 40545141

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Material Type: 文書・図像類
Title: マイクロRNAを介したシグナル伝達機構のシステム解析
Author/Editor: 篠田, 幸作
Author Heading: 篠田, 幸作
Publication Date: 2011
Publication Date (W3CDTF): 2011
Alternative Title: マイクロ RNA オカイシタシグナルデンタツキコウノシステムカイセキ
Maikuro RNA o kaishita shigunaru dentatsu kiko no shisutemu kaiseki
Systems biology analysis of microRNA –mediated signaling dynamics
Periodical title: 科学研究費補助金研究成果報告書
Text Language Code: jpn
Subject Heading: プロテオーム,生体生命情報,オントロジー,シグナル伝達
Target Audience: 一般
Note (General): type:text
microRNA(miRNA)は、内在性のnon-coding RNAであり、標的となる遺伝子の翻訳を制御する。現在、miRNAの役割は、coding RNAを『fine-scale-adjustment(微調整)』する点にあるとされている( Baek et al., Nature 455:64-71, 2008.)。しかし、本研究では、翻訳段階での調節が微小であっても、その先のシグナル伝達では、ダイナミックな変化を引き起こしているのではないかという仮説を検証する。当初計画に基づき、発現制御を通じてシグナル経路に影響を与え、かつ、重要な細胞機能・疾患プロセスに関わっているmiRNAを抽出した。結果、抗がん剤耐性のプロセスに関わっている1つのmiRNAが選択された。選択したmiRNAを、扁平上皮肺がんのモデルであるA549細胞にトランスフェクトし、SILAC培地で培養し、等量混合し、LC-MS(オービトラップ)測定し、heavy/lightの比をとることで、発現プロテオーム・リン酸化プロテオームの相対変化を、グローバルにとらえた。結果、MAPKファミリーの複数のターゲット遺伝子がリストアップされた。当該miRNAは、同一ファミリーの複数の遺伝子をターゲットにし、翻訳を微調整することで、MAPKカスケードをダイナミックに変化させ、A549の抗がん剤耐性に寄与していると考えられた。ウェスタンブロットにおいても、上記の発現変化を確認できた。miRNAとキナーゼが負のフィードバックを通じて互いを制御しあう機構を実証できた。
研究種目 : 若手研究(B) 研究期間 : 2010～2011 課題番号 : 22700315 研究分野 : 総合領域科研費の分科・細目 : 情報学・生体生命情報学
Source: https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_22700315seika
https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_22700315seika
Access Restrictions: 限定公開
Related Material: 科研費研究者番号 : 40545141
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 慶應義塾大学 : 慶應義塾大学学術情報リポジトリ