マルチオミクス解析によるクマムシの乾燥耐性・極限環境耐性分子機構の解明

Material type: 文書・図像類

Author: 荒川, 和晴

Publisher: -

Publication date: 2013

Material Format: Digital

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Note (General)：: type:text陸生のクマムシの多くは周囲の環境の乾燥により、ほぼ完全な脱水を伴って生命活動を可逆的停止する「乾眠」という機構を持つが、その分子機構は未だ明らかではない。そこで、本研究ではヨコヅナクマムシ乾眠前後の主にメタボロームとリン酸化プロテオームによるマルチオミクスにより、有意に変動を示す鍵...

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科研費研究者番号 : 40453550

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Material Type: 文書・図像類
Title: マルチオミクス解析によるクマムシの乾燥耐性・極限環境耐性分子機構の解明
Author/Editor: 荒川, 和晴
Author Heading: 荒川, 和晴
Publication Date: 2013
Publication Date (W3CDTF): 2013
Alternative Title: マルチオミクスカイセキニヨルクマムシノカンソウタイセイ・キョクゲンカンキョウタイセイブンシキコウノカイメイ
Maruchi omikusu kaiseki ni yoru kumamushi no kanso taisei kyokugen kankyo taisei bunshi kiko no kaimei
Multi-omics study to elucidate the molecular mechanism of anhydrobiosis in tardigrade Ramazzottius varieornatus
Periodical title: 科学研究費補助金研究成果報告書
Text Language Code: jpn
Subject Heading: メタボローム,システム生物学,プロテオーム,乾眠,クマムシ,クリプトビオシス,マルチオミクス,バイオインフォマティクス
Target Audience: 一般
Note (General): type:text
陸生のクマムシの多くは周囲の環境の乾燥により、ほぼ完全な脱水を伴って生命活動を可逆的停止する「乾眠」という機構を持つが、その分子機構は未だ明らかではない。そこで、本研究ではヨコヅナクマムシ乾眠前後の主にメタボロームとリン酸化プロテオームによるマルチオミクスにより、有意に変動を示す鍵分子を特定すると共に、その制御機構を解析した。結果、CE-TOFMSとLC-TOFMSを組み合わせたメタボロミクスにより、主に酸化ストレス応答や抗浸透圧ストレス関連の分子の変動がみられ、それらを合成・分解する経路の多くが乾眠時にリン酸化されていることを明らかにした。 Limno-terrestrial tardigrades can withstand extreme environments and almost complete desiccation through a mechanism called anhydrobiosis, but the its molecular mechanism is yet to be explored. To this end, we have conducted a comprehensive multi-omics analysis using the tardigrade Ramazzottius varieornatus, which is a potential model species for anhydrobiosis. In order to analyze the metabolic changes in the active and dehydrated states, we measured the metabolome in both conditions using two types of high-throughput mass spectrometry (MS) systems, CE-TOFMS and LC-TOFMS. Moreover, phospho-proteome was also analyzed to observed the metabolic regulations. As a result, while changes in gene expression profiles are limited in between active and tun states, dynamic changes were observed in the metabolism of this species in response to desiccation. Changes in the metabolic profiles suggests complex intracellular responses to oxidative and osmotic stress.
研究種目 : 若手研究(A) 研究期間 : 2010～2013 課題番号 : 22681029 研究分野 : 複合新領域科研費の分科・細目 : ゲノム科学・ゲノム生物学
Access Restrictions: 限定公開
Related Material: 科研費研究者番号 : 40453550
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 慶應義塾大学 : 慶應義塾大学学術情報リポジトリ