メタボロームの統合化データベースの開発

Material type: 文書・図像類

Author: 杉本, 昌弘

Publisher: -

Publication date: 2013

Material Format: Digital

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Note (General)：: type:text本研究ではデータの標準化が進んでいないメタボローム分野におけるデータの共有化と再利用を効率的に行うために、様々なユーザを想定した公開データベースと関連ツールの開発を行った。格納するデータは、定量値を利用するユーザ向けに代謝物プロファイル(代謝物の濃度パターン)、分子の同定を行う分析...

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科研費研究者番号 : 30458963

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Material Type: 文書・図像類
Title: メタボロームの統合化データベースの開発
Author/Editor: 杉本, 昌弘
Author Heading: 杉本, 昌弘
Publication Date: 2013
Publication Date (W3CDTF): 2013
Alternative Title: メタボロームノトウゴウカデータベースノカイハツ
Metaboromu no togoka detabesu no kaihatsu
Development of integrated database for metabolome data
Periodical title: 科学研究費補助金研究成果報告書
Text Language Code: jpn
Subject Heading: メタボローム,データベース,パスウェイ,可視化,データ解析
Target Audience: 一般
Note (General): type:text
本研究ではデータの標準化が進んでいないメタボローム分野におけるデータの共有化と再利用を効率的に行うために、様々なユーザを想定した公開データベースと関連ツールの開発を行った。格納するデータは、定量値を利用するユーザ向けに代謝物プロファイル(代謝物の濃度パターン)、分子の同定を行う分析者向けに測定生データと、これらに関連した付帯情報(外部データへのリンクや、臨床サンプルなどを取り扱うための情報)を対象とする。また、代謝データを可視化するためのPathway可視化ツールの開発や、臨床情報の組み合わせによるデータ解析ツールも開発した。 This study aimed to develop a database of metabolome data because the standardization of metabolomics data is not well established compared to the other omics data. We have developed MMMDB that contains metabolomics profiles from single mice. We also developed data analysis methods for clinical information usually attached as metabolomic data sample information. The pathway visualization tools that enable users to edit the pathway easiliy.
研究種目 : 若手研究(B) 研究期間 : 2012～2013 課題番号 : 24710215 研究分野 : ゲノム科学科研費の分科・細目 : ゲノム科学・ゲノム生物学
Source: https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_24710215seika
https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_24710215seika
Access Restrictions: 限定公開
Related Material: 科研費研究者番号 : 30458963
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 慶應義塾大学 : 慶應義塾大学学術情報リポジトリ