エピゲノム・バックグラウンドの操作による直接リプログラミング効率の改善

Material type: 文書・図像類

Author: 小田, 真由美ほか

Publisher: -

Publication date: 2014

Material Format: Digital

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Note (General)：: type:text本研究計画では, ES細胞を用いた転写因子の強制発現タイミングと異なる培養条件における細胞分化の傾向と効率を確かめることにより, 直接リプログラミングにおける転写因子の役割分担について検討を行った。転写因子強制発現における遺伝子発現変化より, 影響範囲の違いによる転写因子のグループ...

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科研費研究者番号 : 80567511

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Material Type: 文書・図像類
Title: エピゲノム・バックグラウンドの操作による直接リプログラミング効率の改善
Author/Editor: 小田, 真由美
迫田, 実希
Author Heading: 小田, 真由美
迫田, 実希
Publication Date: 2014
Publication Date (W3CDTF): 2014
Alternative Title: エピゲノム・バックグラウンドノソウサニヨルチョクセツリプログラミングコウリツノカイゼン
Epigenomu bakkuguraundo no sosa ni yoru chokusetsu ripuroguramingu koritsu no kaizen
Optimization of direct reprograming methods by understanding the epigenomic features of descendant cell types.
Periodical title: 科学研究費補助金研究成果報告書
Text Language Code: jpn
eng
Subject Heading: 直接リプログラミング,DNAメチル化,転写因子,ES細胞,エピゲノム
Target Audience: 一般
Note (General): type:text
本研究計画では, ES細胞を用いた転写因子の強制発現タイミングと異なる培養条件における細胞分化の傾向と効率を確かめることにより, 直接リプログラミングにおける転写因子の役割分担について検討を行った。転写因子強制発現における遺伝子発現変化より, 影響範囲の違いによる転写因子のグループ化を行い検討の材料とした。また, 培養条件による分化効率の違いの検討を各種マーカー遺伝子の発現量の違いにより行い, 時系列を追って発現変化を見ることにより転写因子の役割の違いについて明らかにした。対照として, 各種組織のDNAメチル化プロファイルを作成し, 成熟細胞の持つ特徴的なDNAメチル化パターンを明らかにした。 In this study, we assessed the optimization of direct reprogramming method by analyzing the expression data of transcription factor (TF)-induced ES cell lines and found that the efficiency of cell differentiation examined by several cell type-specific markers was changed according to the role of TFs in direct reprogramming process. We also examined different culture conditions that alters genome-wide epigenetic status, and studied the results of TF-induction under different DNA methylation status. For the comparison, DNA methylation profiles of several tissues were made, which is expected to be used for the understanding the cell type-specific epigenomic patterns and the differences between their descendants.
研究種目 : 挑戦的萌芽研究研究期間 : 2013～2014 課題番号 : 25660256 研究分野 : エピゲノム学
Source: https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_25660256seika
https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_25660256seika
Access Restrictions: 限定公開
Related Material: 科研費研究者番号 : 80567511
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 慶應義塾大学 : 慶應義塾大学学術情報リポジトリ