mRNAと新生ペプチドの局所構造による翻訳効率変化のゲノムワイド解析

Material type: 文書・図像類

Author: 中東, 憲治ほか

Publisher: -

Publication date: 2014

Material Format: Digital

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NDC: -

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Note (General)：: type:text遺伝子mRNAからタンパク質が翻訳される状況を新しい実験手法で解析し, ゲノム全体の遺伝子を見た場合, 翻訳開始の構造が翻訳の効率に大きな影響を与えることを明らかにした。対して, 翻訳伸長の効率にも差はあったが, 遺伝子全体の翻訳効率に大きな影響は与えていなかった。また, コドン-...

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科研費研究者番号 : 70322740

科研費研究者番号 : 90182203

科研費研究者番号 : 60260329

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Material Type: 文書・図像類
Title: mRNAと新生ペプチドの局所構造による翻訳効率変化のゲノムワイド解析
Author/Editor: 中東, 憲治
森, 浩禎
金井, 昭夫
Author Heading: 中東, 憲治
森, 浩禎
金井, 昭夫
Publication Date: 2014
Publication Date (W3CDTF): 2014
Alternative Title: mRNA トシンセイペプチドノキョクショコウゾウニヨルホンヤクコウリツヘンカノゲノムワイドカイセキ
mRNA to shinsei pepuchido no kyokusho kozo ni yoru honyaku koritsu henka no genomu waido kaiseki
Genome wide analysis of translation efficiency by local structure of mRNA and nascent peptide
Periodical title: 科学研究費補助金研究成果報告書
Text Language Code: jpn
eng
Subject Heading: リボソームプロファイリング,ゲノム解析技術,リボソーム,翻訳,翻訳制御,コドン
Target Audience: 一般
Note (General): type:text
遺伝子mRNAからタンパク質が翻訳される状況を新しい実験手法で解析し, ゲノム全体の遺伝子を見た場合, 翻訳開始の構造が翻訳の効率に大きな影響を与えることを明らかにした。対して, 翻訳伸長の効率にも差はあったが, 遺伝子全体の翻訳効率に大きな影響は与えていなかった。また, コドン-アンチコドンの3文字目の認識や, small RNA/Hfqによる翻訳制御の実体など, ネイティブな翻訳関連因子の性質についてや, 様々な抗生物質の作用機序など, これまで知られていなかった性質を示す新たな知見を得た。 We performed genome wide analysis of efficiency in mRNA translation to protein, employing new method. We experimentally showed that rate of initiation largely affected the overall efficiency of a gene, while difference in elongation efficiency by codon usage did exist but the effect was much smaller. We also found new insights in the nature of translation apparatus and factors, such as efficiency of non-canonical codon-anticodon recognition at 3rd letter and translational regulation by sRNA/Hfq, as well as effect of nascent-peptide sequence on specificity of various antibiotics.
研究種目 : 基盤研究(B) 研究期間 : 2012～2014 課題番号 : 24310148 研究分野 : システム生物学
Source: https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_24310148seika
https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_24310148seika
Access Restrictions: 限定公開
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科研費研究者番号 : 90182203
科研費研究者番号 : 60260329
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 慶應義塾大学 : 慶應義塾大学学術情報リポジトリ