遺伝子発現エントロピー解析による腫瘍不均一性の検証

Material type: 文書・図像類

Author: 涌井, 昌俊

Publisher: -

Publication date: 2015

Material Format: Digital

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Note (General)：: type:textシャノンのエントロピーや相互情報量に代表される情報理論を応用して, 個々の生物学的経路ごとのトランスクリプトームに反映される腫瘍不均一性を定量することに成功した。事実, 複数のヒトがん細胞株の間や異なる酸素環境条件の培養の間で, 腫瘍不均一性に富む代謝経路および乏しい代謝経路が検出...

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科研費研究者番号 : 90240465

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Material Type: 文書・図像類
Title: 遺伝子発現エントロピー解析による腫瘍不均一性の検証
Author/Editor: 涌井, 昌俊
Author Heading: 涌井, 昌俊
Publication Date: 2015
Publication Date (W3CDTF): 2015
Alternative Title: イデンシハツゲンエントロピーカイセキニヨルシュヨウフキンイツセイノケンショウ
Idenshi hatsugen entoropi kaiseki ni yoru shuyo fukinitsusei no kensho
Investigation of tumor heterogeneity based on analyses of transcriptomic entropy
Periodical title: 科学研究費補助金研究成果報告書
Text Language Code: jpn
eng
Subject Heading: がんの個性診断,腫瘍不均一性,遺伝子発現,エントロピー,情報理論,代謝経路
Target Audience: 一般
Note (General): type:text
シャノンのエントロピーや相互情報量に代表される情報理論を応用して, 個々の生物学的経路ごとのトランスクリプトームに反映される腫瘍不均一性を定量することに成功した。事実, 複数のヒトがん細胞株の間や異なる酸素環境条件の培養の間で, 腫瘍不均一性に富む代謝経路および乏しい代謝経路が検出された。これらの結果は代謝生物学的見地からの腫瘍不均一性への洞察を与え, 診断・治療への応用の可能性を示唆する。 We successfully applied information theory represented by Shannon's entropy and mutual information to quantification of the tumor heterogeneity reflected in the transcriptome in each of biological pathways. In fact, metabolic pathways exhibiting high or low heterogeneity were detected among a number of human cancer cell lines as well as between different oxygen environments of cell culture. These results provide insights into tumor heterogeneity from the perspective of metabolic biology, suggesting the potential of diagnostic and therapeutic application.
研究種目 : 基盤研究(C)(一般) 研究期間 : 2013～2015 課題番号 : 25430139 研究分野 : 腫瘍学
Source: https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_25430139seika
https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_25430139seika
Access Restrictions: 限定公開
Related Material: 科研費研究者番号 : 90240465
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 慶應義塾大学 : 慶應義塾大学学術情報リポジトリ