ゲノムワイド関連解析による心肥大感受性遺伝子の探索

Material type: 文書・図像類

Author: 佐野, 元昭

Publisher: -

Publication date: 2015

Material Format: Digital

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Note (General)：: type:text左室肥大は, 心不全への共通最終経路である。我々はJPDSCのデータベースを用いて健康日本人の心電図で左室重量を反映するV5誘導のR波の起電力(高さ)を規定する遺伝因子をGWASで検討した。RV5に関連しているSNPに関しては独立した日本人集団(長浜コホート研究)を対象に再現性を検...

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科研費研究者番号 : 30265798

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Material Type: 文書・図像類
Title: ゲノムワイド関連解析による心肥大感受性遺伝子の探索
Author/Editor: 佐野, 元昭
Author Heading: 佐野, 元昭
Publication Date: 2015
Publication Date (W3CDTF): 2015
Alternative Title: ゲノムワイドカンレンカイセキニヨルシンヒダイカンジュセイイデンシノタンサク
Genomu waido kanren kaiseki ni yoru shin hidai kanjusei idenshi no tansaku
Identification of genetic determinants of LV mass in a healthy Japanese population by a GWAS
Periodical title: 科学研究費補助金研究成果報告書
Text Language Code: jpn
eng
Subject Heading: 左室肥大,GWAS,TBX3,JPDSC,心電図
Target Audience: 一般
Note (General): type:text
左室肥大は, 心不全への共通最終経路である。我々はJPDSCのデータベースを用いて健康日本人の心電図で左室重量を反映するV5誘導のR波の起電力(高さ)を規定する遺伝因子をGWASで検討した。RV5に関連しているSNPに関しては独立した日本人集団(長浜コホート研究)を対象に再現性を検討した。その結果, TBX3上のSNPrs7301743は, p=7.635 X 10-8で, minor alleleが一つ入るごとに, RV5が0.1mV減高する傾向にあることが明らかとなった。 We have searched for genetic determinants of left ventricular (LV) mass using values for absolute electrocardiographic QRS voltage in a healthy Japanese population. After adjusting for covariates, the corrected S and R wave voltages in leads V1 and V5 from 2,994 healthy volunteers in the Japan Pharmacogenomics Data Science Consortium (JPDSC) database were subjected to a genome-wide association study. Potential associations were validated by an in silico replication study using an independent Japanese population obtained from the Nagahama Prospective Genome Cohort. We identified a novel association between the lead V5, R wave voltage in Japanese individuals and SNP rs7301743[G], which maps near the gene encoding T-box transcription factor Tbx3. Meta-analysis of two independent Japanese datasets demonstrated a marginally significant association of SNP rs7301743 with a 0.071mV (95% CI, 0.038-0.11mV) shorter R wave amplitude in the V5 lead per minor allele copy (P=7.635 x 10-8).
研究種目 : 挑戦的萌芽研究研究期間 : 2014～2015 課題番号 : 26670409 研究分野 : 循環器内科(心臓)
Source: https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_26670409seika
https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_26670409seika
Access Restrictions: 限定公開
Related Material: 科研費研究者番号 : 30265798
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 慶應義塾大学 : 慶應義塾大学学術情報リポジトリ