分光学的手法とインフォマティクスを利用した網羅的神経解剖学の創成

Material type: 文書・図像類

Author: 岡, 浩太郎

Publisher: -

Publication date: 2016

Material Format: Digital

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Note (General)：: type:text脳領域を客合理的に分類する新規手法を開発した。ラマン分光によるスペクトル計測を脳標本で行うことより, ピクセル毎にスペクトル情報を得る。このスペクトル情報を利用して, スペクトルが似た領域を抽出し, マッピングした。この結果, 神経線維をラッピングしているミエリンや, セロトニン,...

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科研費研究者番号 : 10276412

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Material Type: 文書・図像類
Title: 分光学的手法とインフォマティクスを利用した網羅的神経解剖学の創成
Author/Editor: 岡, 浩太郎
Author Heading: 岡, 浩太郎
Publication Date: 2016
Publication Date (W3CDTF): 2016
Alternative Title: ブンコウガクテキシュホウトインフォマティクスオリヨウシタモウラテキシンケイカイボウガクノソウセイ
Bunkogakuteki shuho to infomatikusu o riyoshita morateki shinkei kaibogaku no sosei
Comprehensive neuroanatomy by using non-staining imaging and informatics
Periodical title: 科学研究費補助金研究成果報告書
Text Language Code: jpn
eng
Subject Heading: 生体生命情報学,生物物理,神経科学,細胞・組織,可視化
Target Audience: 一般
Note (General): type:text
脳領域を客合理的に分類する新規手法を開発した。ラマン分光によるスペクトル計測を脳標本で行うことより, ピクセル毎にスペクトル情報を得る。このスペクトル情報を利用して, スペクトルが似た領域を抽出し, マッピングした。この結果, 神経線維をラッピングしているミエリンや, セロトニン, ドーパミン, グルタミン酸含有細胞を非染色で検出することができた。また脳領域境界を合理的に決定する方法として, 核位置を利用したボロノイ分割を試みた。その結果, 鳥脳のコロナルセクション全体をボロノイユニットに分割することができた。この分割法と非染色イメージングを併用することにより, 脳ドラフトマップを高速に作成することが可能となる。 We have developed a new method to classify brain regions rationally. We obtain Raman spectral information for each pixel on the brain slices of songbirds. Using this spectral information, regions with similar spectra were extracted and mapped. As a result, myelin wrapped nerve fibers and several neurons with neurotransmitters (serotonin, dopamine and glutamate) could be detected without staining. As a method to rationally determine the brain region boundary, we attempted Voronoi division using nuclear position. As a result, we succeeded to divide the entire coronal section of the bird's brain into Voronoi units. By using this division method together with unstained imaging, it is possible to construct a brain draft map at high speed.
研究種目 : 挑戦的萌芽研究研究期間 : 2015～2016 課題番号 : 15K12143 研究分野 : システム生物学・神経科学
Source: https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_15K12143seika
https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_15K12143seika
Access Restrictions: 限定公開
Related Material: 科研費研究者番号 : 10276412
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 慶應義塾大学 : 慶應義塾大学学術情報リポジトリ