新規の遺伝子網羅的解析法による肝細胞癌分子標的薬に対する薬剤耐性遺伝子の同定

Material type: 文書・図像類

Author: 阿部, 雄太ほか

Publisher: -

Publication date: 2016

Material Format: Digital

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Note (General)：: type:text各細胞株のTTCを作成した。MTT assay法により薬剤指摘濃度を確認した後に樹立したTTCを用いてソラフェニブを添加した。その結果HepG2については約10種類, PLC/PRF/5については約20種類のコロニーがピックアップされた。ゲノムDNAを抽出しソラフェニブ耐性遺伝子の...

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科研費研究者番号 : 70327526

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Digital

Material Type: 文書・図像類
Title: 新規の遺伝子網羅的解析法による肝細胞癌分子標的薬に対する薬剤耐性遺伝子の同定
Author/Editor: 阿部, 雄太
林田, 哲
Author Heading: 阿部, 雄太
林田, 哲
Publication Date: 2016
Publication Date (W3CDTF): 2016
Alternative Title: シンキノイデンシモウラテキカイセキホウニヨルカンサイボウガンブンシヒョウテキヤクニタイスルヤクザイタイセイイデンシノドウテイ
Shinki no idenshi morateki kaisekiho ni yoru kansaibogan bunshi hyotekiyaku ni taisuru yakuzai taisei idenshi no dotei
Comprehensive screening of genes resistant to sorafenib in hepatocellular carcinoma
Periodical title: 科学研究費補助金研究成果報告書
Text Language Code: jpn
eng
Subject Heading: 肝細胞癌,化学療法,ソラフェニブ
Target Audience: 一般
Note (General): type:text
各細胞株のTTCを作成した。MTT assay法により薬剤指摘濃度を確認した後に樹立したTTCを用いてソラフェニブを添加した。その結果HepG2については約10種類, PLC/PRF/5については約20種類のコロニーがピックアップされた。ゲノムDNAを抽出しソラフェニブ耐性遺伝子の候補遺伝子を同定することが可能であった。DNAを抽出し, トランスポゾンにより挿入された箇所を制限酵素処理にて切り出しDNAを増幅させ, その塩基配列を同定し, 遺伝子を同定した。複数の耐性コロニーに共通して出現している遺伝子が幾つか同定され, これが投与薬剤に対する耐性遺伝子候補としてピックアップされた。 We used a novel method involving transposons to screen and identify drug-resistant genes. Transposons are DNA sequences that move from one location on the gene to another. A modified piggyBac transposon was designed as an insertion mutagen, and a cytomegalovirus (CMV) promoter sequence was added to induce strong transcription. When the transposon is inserted to the upstream of a certain gene, the gene will be overexpressed while when intserted down or intragenically, it will be downregulated. After establishing a transposon-tagged cell library, we treated cell lines derived from Hepatocellular carcinoma. We performed splinkerette PCR and TOPO cloning on the resistant colonies. Bacterial colonies were sequenced, and next-generation sequencing was used to identify the overexpressed/downregulated sequences as candidate genes for Sorafenib resistance. We identified several candidate genes from 30 resistant colonies.
研究種目 : 基盤研究(C)(一般) 研究期間 : 2014～2016 課題番号 : 26461019 研究分野 : 消化器外科
Source: https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_26461019seika
https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_26461019seika
Access Restrictions: 限定公開
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科研費研究者番号 : 80327543
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 慶應義塾大学 : 慶應義塾大学学術情報リポジトリ