分子クラウディング環境下における生体分子の機能的構造揺らぎの解析

Material type: 文書・図像類

Author: 苙口, 友隆ほか

Publisher: -

Publication date: 2019

Material Format: Digital

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Note (General)：: type:text細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、...

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科研費研究者番号 : 90589821

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科研費研究者番号 : 80563840

科研費研究者番号 : 50245370

科研費研究者番号 : 30782643

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Material Type: 文書・図像類
Title: 分子クラウディング環境下における生体分子の機能的構造揺らぎの解析
Author/Editor: 苙口, 友隆
杉山, 正明
井上, 倫太郎
中村, 敏和
浅田, 瑞枝
Author Heading: 苙口, 友隆
杉山, 正明
井上, 倫太郎
中村, 敏和
浅田, 瑞枝
Publication Date: 2019
Publication Date (W3CDTF): 2019
Alternative Title: ブンシクラウディングカンキョウカニオケルセイタイブンシノキノウテキコウゾウユラギノカイセキ
Bunshi kuraudingu kankyōka ni okeru seitai bunshi no kinōteki kōzō yuragi no kaiseki
Visualization of protein dynamics in molecular crowding environment
Periodical title: 科学研究費補助金研究成果報告書
Text Language Code: jpn
eng
Subject Heading: 分子クラウディング,蛋白質ダイナミクス,分子動力学シミュレーション,溶液中性子散乱,溶液X線散乱
Target Audience: 一般
Note (General): type:text
細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、そのような環境下における蛋白質の構造揺らぎを可視化する必要が有るが、それを可能とする測定手法は存在しない。そこで、本研究においては、分子クラウディング環境下においても目的分子の構造情報のみを得る先端計測手法と、分子動力学シミュレーションを組み合わせた手法の開発を主に理論面から進めた。 The recent studies have shown that protein functions are modulated in molecular crowding environment such as intracellular environment. However, since there are no methods that can visualize protein dynamics in molecular crowding environment, the mechanism of how the environment modulates protein functions is unclear. In our previous studies, we have developed the MD-SAXS method that combines molecular dynamics simulation and solution X-ray scattering experiment, and the method enables us to visualize protein dynamics in dilute solution of in vitro. In this study, we are developing the method that visualizes protein dynamics in molecular crowding environment based on the MD-SAXS method.
研究種目 : 挑戦的研究 (萌芽) 研究期間 : 2017～2019 課題番号 : 17K19209 研究分野 : 生物物理
Source: https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_17K19209seika
https://koara.lib.keio.ac.jp/xoonips/modules/xoonips/download.php?koara_id=KAKEN_17K19209seika
Access Restrictions: 限定公開
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科研費研究者番号 : 50245370
科研費研究者番号 : 30782643
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 慶應義塾大学 : 慶應義塾大学学術情報リポジトリ