レクチン・複合糖鎖結合予測のための統計的方法論の開発

Material type: 文書・図像類

Author: 広瀬, 修ほか

Publisher: 金沢大学理工研究域生命理工学系

Publication date: 2014-06-03

Material Format: Digital

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NDC: -

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Note (General)：: 糖鎖は単糖類が重合した物質で，特に複合糖鎖と呼ばれる糖鎖は細胞表面などに存在する糖タンパク質に結合し，発生・分化・免疫・癌化・感染といった生体内のあらゆる局面で重要な役割を果たす．糖鎖に対する構造解析法の近年の急激な進展によって，糖鎖や糖鎖認識タンパク質であるレクチンに関する情報が急速に蓄積しつつあ...

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Material Type: 文書・図像類
Title: レクチン・複合糖鎖結合予測のための統計的方法論の開発
Author/Editor: 広瀬, 修
Hirose, Osamu
Author Heading: 広瀬, 修
Hirose, Osamu
Publication, Distribution, etc.: 金沢大学理工研究域生命理工学系
Publication Date: 2014-06-03
Publication Date (W3CDTF): 2014-06-03
Alternative Title: Statistical inference of lection-carbohydrate binding
Periodical title: 平成25(2013)年度科学研究費補助金研究活動スタート支援研究成果報告書 = 2013 Fiscal Year Final Research Report
No. or year of volume/issue: 2012-04-01 - 2014-03-31
Volume: 2012-04-01 - 2014-03-31
Pages: 4p.-
Text Language Code: jpn
Subject Heading: レクチン
複合糖鎖
判別分析
機械学習
Target Audience: 一般
Note (General): 糖鎖は単糖類が重合した物質で，特に複合糖鎖と呼ばれる糖鎖は細胞表面などに存在する糖タンパク質に結合し，発生・分化・免疫・癌化・感染といった生体内のあらゆる局面で重要な役割を果たす．糖鎖に対する構造解析法の近年の急激な進展によって，糖鎖や糖鎖認識タンパク質であるレクチンに関する情報が急速に蓄積しつつあり，糖鎖生物学の飛躍的な進展が期待されている．本研究課題期間に特にレクチンに関して以下の様な進捗があった．(1)タンパク質データベースからのレクチンの配列情報の取得およびキュレーション．(2)局所フィッシャー判別分析による配列情報からのレクチン予測．(3)レクチンを特徴付けるアミノ酸配列の推定．
Among carbohydrates which are polymers of monosaccharaides, glycoconjugates bind to glycoproteins and play important and various roles in the process of development, differentiation, immunity, canceration, and infection. Owing to the recent development of mass spectrometry and liquid chromatography, information about glycoconjugates and lectins has rapidly accumulated. The accumulation is expected to activate researches about glycoinformatics. In our study, we obtained the following results: (1) Collection and curation of amino acid sequences for lectins, (2) Prediction of lectins from amino acid sequences using local Fisher discriminant analysis, and (3) Inference of amino acid subsequences that characterizes whether proteins are lectins or not.
研究課題/領域番号:24810010, 研究期間(年度):2012-04-01 - 2014-03-31
出典：研究課題「レクチン・複合糖鎖結合予測のための統計的方法論の開発」課題番号24810010（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-24810010/24810010seika/）を加工して作成
DOI: 10.24517/00052187
Source: https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=45853&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=45853&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
Access Restrictions: 限定公開
Rights (production): CC BY-NC-ND
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https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24810010/
https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-24810010/24810010seika/
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 金沢大学 : 金沢大学学術情報リポジトリKURA