循環器コホート分析における血縁構造化の影響の調査

Material type: 文書・図像類

Author: 柴田, 恭子ほか

Publisher: 金沢大学附属病院先端医療開発センター

Publication date: 2014-06-10

Material Format: Digital

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NDC: -

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Note (General)：: 地域集団サンプル1,617人を用いて、一塩基多型を用いたゲノムワイド関連解析により血縁構造を検出し（20.2%）、極めて近い血縁者を除外した集団と、除外しない集団で、表現型と環境因子との関連性の結果に違いがあるか検証した。表現型データとして血圧値、リスク環境因子としてBMI、喫煙歴、飲酒歴を用いた。...

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Material Type: 文書・図像類
Title: 循環器コホート分析における血縁構造化の影響の調査
Author/Editor: 柴田, 恭子
Shibata, Kyoko
Author Heading: 柴田, 恭子
Shibata, Kyoko
Publication, Distribution, etc.: 金沢大学附属病院先端医療開発センター
Publication Date: 2014-06-10
Publication Date (W3CDTF): 2014-06-10
Alternative Title: The confounding effect of cryptic relatedness for environmental risks of systolic blood pressure on cohort studies
Periodical title: 平成24(2012)年度科学研究費補助金挑戦的萌芽研究研究成果報告書 = 2013 Fiscal Year Final Research Report
No. or year of volume/issue: 2012-04-01 - 2013-03-31
Volume: 2012-04-01 - 2013-03-31
Pages: 5p.-
Text Language Code: jpn
Subject Heading: 血縁構造化
Target Audience: 一般
Note (General): 地域集団サンプル1,617人を用いて、一塩基多型を用いたゲノムワイド関連解析により血縁構造を検出し（20.2%）、極めて近い血縁者を除外した集団と、除外しない集団で、表現型と環境因子との関連性の結果に違いがあるか検証した。表現型データとして血圧値、リスク環境因子としてBMI、喫煙歴、飲酒歴を用いた。交絡因子としての血縁構造化の影響が深刻な問題となる検証結果は少なかったが、遺伝率の大きさによりバイアスが係る可能性が示唆され、今後更なる詳細な検証が必要である。
We investigated the confounding effect of unadjusted cryptic relatedness (CR) among a rural cohort in the relationship between environmental risk factors (body mass index, smoking status, alcohol consumption) and systolic blood pressure (SBP). We applied the methods of population-based whole-genome association studies for the analysis of the genome-wide SNP data in 1622 subjects, and detected 20.2% CR in this cohort population. In conclusion, we found a confounding effect of CR in the relationship between SBP and environmental risk factors was not negligible. In our study, we showed that heritability for liability might reflect on the estimation of regression coeffients between SBP and environmental risk factors, because they vary with environmental risk factors that differ across some unsuspected relatedness.
研究課題/領域番号:24659316, 研究期間(年度):2012-04-01 - 2013-03-31
出典：研究課題「循環器コホート分析における血縁構造化の影響の調査」課題番号24659316（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-24659316/24659316seika/）を加工して作成
DOI: 10.24517/00052957
Access Restrictions: 限定公開
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https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24659316/
https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-24659316/24659316seika/
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 金沢大学 : 金沢大学学術情報リポジトリKURA