光化学反応に於ける光照射ストレス下の電子伝達体ダイナミックスに関する理論的研究

Material type: 文書・図像類

Author: 長尾, 秀実ほか

Publisher: -

Publication date: 2018-06-11

Material Format: Digital

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Note (General)：: 金沢大学理工研究域数物科学系光化学反応における電子伝達体の会合解離過程と拡散過程を理論的に解析し次の主な結果を得た。(1)全原子分子動力学シミュレーションからプラストシアニンとシトクロムfの酸化還元反応に関わる自由エネルギープロファイルを算出した。プラストシアニンからシトクロムfへの電子移動のポテン...

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Material Type: 文書・図像類
Title: 光化学反応に於ける光照射ストレス下の電子伝達体ダイナミックスに関する理論的研究
Author/Editor: 長尾, 秀実
Nagao, Hidemi
Author Heading: 長尾, 秀実
Nagao, Hidemi
Publication Date: 2018-06-11
Publication Date (W3CDTF): 2018-06-11
Alternative Title: Theoretical study on dynamics of electron carriers in photosynthesis stressed by light irradiation
Periodical title: 平成29(2017)年度科学研究費補助金基盤研究(C) 研究成果報告書 = 2017 Fiscal Year Final Research Report
No. or year of volume/issue: 2014-04-01 - 2018-03-31
Volume: 2014-04-01 - 2018-03-31
Pages: 6p.-
Text Language Code: jpn
Subject Heading: 光化学反応
電子伝達体
会合解離過程
プラストシアニン
シトクロムf
拡散過程
光照射ストレス
Target Audience: 一般
Note (General): 金沢大学理工研究域数物科学系
光化学反応における電子伝達体の会合解離過程と拡散過程を理論的に解析し次の主な結果を得た。(1)全原子分子動力学シミュレーションからプラストシアニンとシトクロムfの酸化還元反応に関わる自由エネルギープロファイルを算出した。プラストシアニンからシトクロムfへの電子移動のポテンシャル障壁はほとんどないと結論できた。(2)タンパク質間相互作用を取り入れた新しい粗視化モデルを提案した。粗視化モデル解析から両タンパク質の活性部位間距離と電子移動反応係数に正の相関を見出した。(3)光照射下の電子伝達体の拡散過程の解析からチラコイドルーメンの膜タンパク質による障害が反応活性増減の一つの要因となると示唆できた。
The association/dissociation process of the electron carriers in photosynthesis has been theoretically and numerically investigated in relation to the diffusion of the proteins. The following main results have been obtained in this study. (1) Free energy profile of plastocyanin, which is one of carriers to bring one electron to cytochrome f, has been calculated by all-atom molecular dynamics simulations. The result suggests that there is no potential barrier for the electron transfer. (2) A novel coarse-grained model describing intermolecular interactions has been proposed, and the results by simulations suggest the positive correlation between the distance between the active sites and the reaction coefficient of the electron transfer. (3) Some simulations for the diffusion of plastocyanin inside the thylakoid lumen suggest that the obstacle by membrane proteins in thylakoid membrane for the electron carrier contribute to the decrease of the activity of the electron transfer.
研究課題/領域番号:26400429, 研究期間(年度):2014-04-01 - 2018-03-31
出典：研究課題「光化学反応に於ける光照射ストレス下の電子伝達体ダイナミックスに関する理論的研究」課題番号26400429（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-26400429/26400429seika/）を加工して作成
DOI: 10.24517/00052893
Access Restrictions: 限定公開
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https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26400429/
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Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 金沢大学 : 金沢大学学術情報リポジトリKURA