ポリユビキチン化基質蛋白質の網羅的同定

Material type: 文書・図像類

Author: 太田, 一寿ほか

Publisher: -

Publication date: 2016-04-21

Material Format: Digital

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Note (General)：: 東京大学 / 金沢大学蛋白質のユビキチン化は、プロテアソームによる分解や、エンドサイトーシスなどの様々な生命現象を調節する重要な翻訳後修飾の一つである。従来のユビキチン化基質の同定は場当たり的で、サイクリンなどの一部の蛋白質群に集中していたが、近年、出芽酵母を用いた網羅的基質同定の結果が海外の研究グ...

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Material Type: 文書・図像類
Title: ポリユビキチン化基質蛋白質の網羅的同定
Author/Editor: 太田, 一寿
Ota, Kazuhisa
Author Heading: 太田, 一寿
Ota, Kazuhisa
Publication Date: 2016-04-21
Publication Date (W3CDTF): 2016-04-21
Periodical title: 平成16(2004)年度科学研究費補助金若手研究(B) 研究概要 = 2004 Research Project Summary
No. or year of volume/issue: 2003 – 2004
Volume: 2003 – 2004
Pages: 1p.-
Text Language Code: jpn
Subject Heading: 出芽酵母
ユビキチン化
プロテオミクス
ユビキチン
MS
General medical chemistry
Target Audience: 一般
Note (General): 東京大学 / 金沢大学
蛋白質のユビキチン化は、プロテアソームによる分解や、エンドサイトーシスなどの様々な生命現象を調節する重要な翻訳後修飾の一つである。従来のユビキチン化基質の同定は場当たり的で、サイクリンなどの一部の蛋白質群に集中していたが、近年、出芽酵母を用いた網羅的基質同定の結果が海外の研究グループより報告され、プロテオミクス解析へとそのフィールドを移した感がある。そこで、我々も、以前から開発してきたユビキチン化基質蛋白質の網羅的検出システムの独自性をアピールするとともに、その基質プロファイリングへの応用を試みた。<実験結果>昨年度に引き続き、ポリユビキチン化蛋白質を優先的に濃縮できる「パラレルタグ(PAP)法」の改良・応用を行ってきた。PAP法とは我々が独自に考案した方法で、それぞれが異なるタグで標識されたユビキチンを同時に発現させてポリユビキンチン鎖に2種類のタグを取り込ませ、次にそれぞれのタグに対するアフィニティ精製を連続して行うシステムである。これにより、ポリユビキチン化蛋白質を選択的、高純度に精製する事が可能となる。実際に、PAP法で得られたサンプルをLC/MS/MSで解析したところ、既知のものを含め130種以上の基質蛋白質候補が同定された。そこでそのうち新規のものに個別に検討を加えたところ、約80%程度においてユビキチン化が確認され、中には刺激によるユビキチン化の程度に変動が認められたものもあった。また、基質プロファイリングへの第一歩として、F-box蛋白質:MET30p過剰発現下での基質蛋白質:MET4pのPAP法による濃縮状況を調べたところ、MET30p依存的なユビキチン化MET4p収量の増減を認め、網羅的プロファイリングへの応用が可能であると判断した。
研究課題/領域番号:15790148, 研究期間(年度):2003 – 2004
出典：「ポリユビキチン化基質蛋白質の網羅的同定」研究成果報告書　課題番号15790148（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））（https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-15790148/)を加工して作成
DOI: 10.24517/00061116
Source: https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=54840&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=54840&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
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Rights (production): CC BY-NC-ND
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Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 金沢大学 : 金沢大学学術情報リポジトリKURA