ヒトゲノム情報に基づく系統的メチル化解析によるがん関連インプリント遺伝子の検索

Material type: 文書・図像類

Author: 太田, 一寿ほか

Publisher: -

Publication date: 2018-03-28

Material Format: Digital

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Note (General)：: 金沢大学がん進展制御研究所1)ヒト21番染色体配列情報から一定基準に基づいてin silicoで抽出した全CpGアイランド(CGI)149個について、新規に開発したHpaII-McrBC PCR法を駆使して、正常人末梢血由来DNAでのアレル別メチル化状態を検討した。その結果、70%のCGIはメチル化...

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Material Type: 文書・図像類
Title: ヒトゲノム情報に基づく系統的メチル化解析によるがん関連インプリント遺伝子の検索
Author/Editor: 太田, 一寿
Ota, Kazuhisa
Author Heading: 太田, 一寿
Ota, Kazuhisa
Publication Date: 2018-03-28
Publication Date (W3CDTF): 2018-03-28
Periodical title: 平成14(2002)年度科学研究費補助金特定領域研究研究概要 = 2002 Research Rroject Summary
No. or year of volume/issue: 2002
Volume: 2002
Pages: 1p.-
Text Language Code: jpn
Subject Heading: メチル化
CpGアイランド
HpaII
McrBC
ヒト21番染色体
出芽酵母
1ハイブリッド
M.SssI
Biological Sciences
Target Audience: 一般
Note (General): 金沢大学がん進展制御研究所
1)ヒト21番染色体配列情報から一定基準に基づいてin silicoで抽出した全CpGアイランド(CGI)149個について、新規に開発したHpaII-McrBC PCR法を駆使して、正常人末梢血由来DNAでのアレル別メチル化状態を検討した。その結果、70%のCGIはメチル化を受けていなかったが、意外なことに20%ものCGIが両アレルともにメチル化されていることが判明した。更に7つのCGIは片側アレルのみがメチル化をされていた。これらのうち3つのCGIに関しては、SNP情報と家系を利用した解析が可能であった。2つのCGIは母性アレルがメチル化を受けていたが、残るひとつは由来する親の性にはよらない、つまり非インプリンティング型の片アレルメチル化、という新しいタイプを示すことが判明した。ヒト21番染色体と相同なマウス16番染色体領域やチンパンジー22番染色体の解析にも着手し、これらのメチル化の持つ意味を探っている。2)メチル化CGIを認識してこれにトランスに作用する因子をin vivoのクロマチン状態で解析・検索する目的で、出芽酵母内で特定の配列をメチル化する実験系を構築した。具体的には、LexAオペレータを介してLexA融合蛋白質として発現させた細菌由来de novo CpGメチレースM.SssIを標的配列近傍にリクルートして、そのメチル化を行わせることを試みた。その結果、この方法で標的配列をメチル化し得ることが示された。更に、これと1ハイブリッドシステムを組み合わせた系で、メチル化標的配列とメチルDNA結合蛋白質との相互作用を検出することに成功した。これはin vivoのクロマチン状態でのメチル化DNAとメチル化DNA結合蛋白質の相互作用を解析した最初の例である。現在、この系を用いた新規結合蛋白質の検索を進めている。
研究課題/領域番号:14026015, 研究期間(年度):2002
出典：「ヒトゲノム情報に基づく系統的メチル化解析によるがん関連インプリント遺伝子の検索」研究成果報告書　課題番号14026015（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））（https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-14026015/)を加工して作成
DOI: 10.24517/00060569
Source: https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=54293&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=54293&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
Access Restrictions: 限定公開
Rights (production): CC BY-NC-ND
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https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-14026015/
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 金沢大学 : 金沢大学学術情報リポジトリKURA