16SrRNA解析を用いた細菌同定

Material type: 文書・図像類

Author: 坂井-竹森, 優喜子ほか

Publisher: -

Publication date: 2016-12-27

Material Format: Digital

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Note (General)：: 金沢大学附属病院1. 研究目的多くの微生物検査室では、コロニー性状、栄養要求性、生化学的性状により細菌を同定する。しかし、日常検査では変異株や稀な菌などの同定困難な菌に遭遇することが珍しくない。本研究では、①16S rRNA解析を行い、同定困難であった細菌を同定すること、②解析株の表現型および菌株出...

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Material Type: 文書・図像類
Title: 16SrRNA解析を用いた細菌同定
Author/Editor: 坂井-竹森, 優喜子
Sakai-Takemori, Yukiko
Author Heading: 坂井-竹森, 優喜子
Sakai-Takemori, Yukiko
Publication Date: 2016-12-27
Publication Date (W3CDTF): 2016-12-27
Periodical title: 平成27(2015)年度科学研究費補助金奨励研究研究概要 = 2015 Research Project Summary
No. or year of volume/issue: 2015
Volume: 2015
Pages: 1p.-
Text Language Code: jpn
Subject Heading: 16SrRNA解析
Sphingomonas paucimobilis
カタラーゼ陰性黄色ブドウ球菌
Clinical medicine
Target Audience: 一般
Note (General): 金沢大学附属病院
1. 研究目的多くの微生物検査室では、コロニー性状、栄養要求性、生化学的性状により細菌を同定する。しかし、日常検査では変異株や稀な菌などの同定困難な菌に遭遇することが珍しくない。本研究では、①16S rRNA解析を行い、同定困難であった細菌を同定すること、②解析株の表現型および菌株出現の臨床背景を検討することを目的とする。2. 研究方法日常検査において同定困難であった株を対象とした。16S rRNA解析は大楠らの方法に従い、菌株のDNA抽出(煮沸法)⇒16S rRNA領域の増幅(PCR法)⇒増幅産物の精製⇒シーケンス反応⇒DNA配列の解読⇒相同性検索(BLAST, BlBl, EzTaxon-e)により行なった。表現型はコロニー性状、生化学的性状を中心に観察した。菌株の出現背景は診療録を参照した。3. 主な研究成果(1) 16S rRNA解析結果 : Sphingomonas paucimobilisオキシダーゼ弱陽性、黄色色素産生、DNase陽性のグラム陰性桿菌。特に黄色色素産生が特徴的であった。NF18(ニッスイ)で同定可能であった。Walk away (ベックマン・コールター)では同定確率50%で本菌種と同定された。S. paucimobillusの病原性は低く日和見感染症の起因菌とされている。本症例は免疫抑制の患者で、分離材料より起因菌と推測され貴重な症例と思われた。(2) 16SrRNA解析結果 : Staphylococcus aureus本菌は免疫抑制状態である患者の口腔由来検体より検出された。カタラーゼ陰性のグラム陽性球菌で、コロニーはS. aureus様で、PSラテックス栄研、LV反応陽性であった。Walk away (ベックマン・コールター)では99.9%の確率でS. aureusと同定された。以上より、カタラーゼ陰性のS. aureusと同定された。Staphylococcus属は通常カタラーゼ陽性であり、検査ではカタラーゼ陰性株の存在を考慮すべきと思われた。
研究課題/領域番号:15H00624, 研究期間(年度):2015
DOI: 10.24517/00060657
Source: https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=54381&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=54381&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
Access Restrictions: 限定公開
Rights (production): CC BY-NC-ND
Related Material: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15H00624/
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 金沢大学 : 金沢大学学術情報リポジトリKURA