メタン酸化酵素遺伝子を有する未培養微生物の網羅的系統分類とrRNAアプローチ

Material type: 文書・図像類

Author: 松浦, 哲久ほか

Publisher: -

Publication date: 2021-06-08

Material Format: Digital

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Note (General)：: 金沢大学理工研究域地球社会基盤学系本研究では、アンプリコンPCRベースで16S rRNA遺伝子と機能遺伝子をリンクづけて解析する技術の開発を行い、環境サンプルに存在する未培養メタン酸化細菌の系統を明らかにすることを目的とした。純粋菌株を用いた実験では、エマルジョンを用いた遺伝子結合PCRを実施し、そ...

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Material Type: 文書・図像類
Title: メタン酸化酵素遺伝子を有する未培養微生物の網羅的系統分類とrRNAアプローチ
Author/Editor: 松浦, 哲久
Matsuura, Norihisa
Author Heading: 松浦, 哲久
Matsuura, Norihisa
Publication Date: 2021-06-08
Publication Date (W3CDTF): 2021-06-08
Alternative Title: Phylogeny of uncultured bacteria possessing pmoA gene and rRNA approach
Periodical title: 令和2(2020)年度科学研究費補助金若手研究研究成果報告書 = 2020 Fiscal Year Final Research Report
No. or year of volume/issue: 2018-04-01 – 2021-03-31
Volume: 2018-04-01 – 2021-03-31
Pages: 5p.-
Text Language Code: jpn
Subject Heading: 16S rRNA遺伝子
pmoA遺伝子
メタン酸化細菌
遺伝子結合PCR
Target Audience: 一般
Note (General): 金沢大学理工研究域地球社会基盤学系
本研究では、アンプリコンPCRベースで16S rRNA遺伝子と機能遺伝子をリンクづけて解析する技術の開発を行い、環境サンプルに存在する未培養メタン酸化細菌の系統を明らかにすることを目的とした。純粋菌株を用いた実験では、エマルジョンを用いた遺伝子結合PCRを実施し、その精度を評価した。環境サンプルの調査では、土壌サンプルにおいて未培養メタン酸化細菌の割合が多いことがわかった。遺伝子結合PCRをそのサンプルへ適用し、1種類の未培養メタン酸化細菌の系統（16S rRNA遺伝子）を明らかにした。
We developed an emulsion fusion PCR to link between 16S rRNA gene and functional gene. The fusion PCR was evaluated using a pure cultures experiment. And an uncultured methanotroph is discovered in forest soils as high population. We applied the developed tool to the sample and determined the phylogeny of the uncultured methanotroph.
研究課題/領域番号:18K14777, 研究期間(年度):2018-04-01 – 2021-03-31
出典：「メタン酸化酵素遺伝子を有する未培養微生物の網羅的系統分類とrRNAアプローチ」研究成果報告書　課題番号18K14777（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））（https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-18K14777/18K14777seika/）を加工して作成
DOI: 10.24517/00058368
Source: https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=52068&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=52068&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
Access Restrictions: 限定公開
Rights (production): CC BY-NC-ND
Related Material: https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=90771585
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18K14777/
https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-18K14777/18K14777seika/
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 金沢大学 : 金沢大学学術情報リポジトリKURA