プロテオミクスで紐解くヤポネシア人の食生活の復元

Material type: 文書・図像類

Author: 西内, 巧ほか

Publisher: -

Publication date: 2021-12-27

Material Format: Digital

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Note (General)：: 金沢大学学際科学実験センター多様な年代や地域で出土する動植物遺体中に残存する微量ペプチドの同定により、ヤポネシア人の動植物利用の復元を試みる。さらに歯石や土器付着物等のより複雑な試料についてもプロテオミクス解析を行うことで、ヤポネシア人の食生活や疾患を復元し、ヤポネシアへの渡来と定着の過程における食...

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Material Type: 文書・図像類
Title: プロテオミクスで紐解くヤポネシア人の食生活の復元
Author/Editor: 西内, 巧
Nishiuchi, Takumi
Author Heading: 西内, 巧
Nishiuchi, Takumi
Publication Date: 2021-12-27
Publication Date (W3CDTF): 2021-12-27
Alternative Title: Elucidation of Yaponesian diet habt by proteomic approach
ゲノム配列を核としたヤポネシア人の起源と成立の解明
Deciphering Origin and Establishment of Japonesians mainly based on genome sequence data
Periodical title: 令和2(2020)年度科学研究費補助金新学術領域研究(研究領域提案型) 研究実績の概要 = 2020 Research Project Summary
No. or year of volume/issue: 2019-04-01 – 2021-03-31
Volume: 2019-04-01 – 2021-03-31
Pages: 2p.-
Text Language Code: jpn
Subject Heading: 遺跡出土品
メタボロミクス
プロテオミクス
植物遺体
土器付着物
食性復元
コラーゲン
歯石
Target Audience: 一般
Note (General): 金沢大学学際科学実験センター
多様な年代や地域で出土する動植物遺体中に残存する微量ペプチドの同定により、ヤポネシア人の動植物利用の復元を試みる。さらに歯石や土器付着物等のより複雑な試料についてもプロテオミクス解析を行うことで、ヤポネシア人の食生活や疾患を復元し、ヤポネシアへの渡来と定着の過程における食生活、疾病や動植物利用の変遷を明らかにする。
遺跡から出土する動物骨中のコラーゲンタンパク質は非常に安定であり、歯石中に残されたタンパク質も古代人の疾患や食生活の復元について有用な知見をもたらす。一方で、植物遺存体は、イネ果実のように経年により炭化することも多く、タンパク質の分析については実験系が確立されていない。本研究では、動物骨や歯石のプロテオーム解析に加えて、炭化米等の植物遺存体からタンパク質を抽出・精製する方法について検討を進め、質量分析計を用いたショットガンプロテオミクスを行っている。前年度に開発したアセトン沈殿によるタンパク質精製を改良した方法を用いることで、弥生時代の福岡の2遺跡と韓国の1遺跡の3種のイネ果実（炭化米）試料から、多数のペプチドを検出し、多くのタンパク質を同定することができた。同定されたタンパク質の多くは、イネ種子に特異的に蓄積していると報告されていたタンパク質であり、中でも、63kDグロブリン様タンパク質は、3遺跡全ての試料で同定され、いずれも多数のペプチド(4-12本)が検出された。イネ科には、この63kDグロブリン様タンパク質と類似なタンパク質が存在し、キビ属とは70％弱の類似性であり、異なるアミノ酸配列が多数見出されたことから、イネとキビなどの雑穀を分別できるマーカータンパク質の候補と考えられた。また、ジャポニカとインディカにおいても複数のアミノ酸が異なっており、多数のペプチドを検出できれば、判別が可能であると考えられた。また、土器付着物についても、植物遺存体を用いた上記に類似した方法を適応して解析を進めており、植物だけではなく、動物や微生物由来のタンパク質も検出されており、土器付着物のプロテオーム解析による食生活の復元に向けた実験基盤を確立することができた。
研究課題/領域番号:19H05345, 研究期間(年度):2019-04-01 – 2021-03-31
出典：研究課題「プロテオミクスで紐解くヤポネシア人の食生活の復元」課題番号19H05345（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所））（https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PUBLICLY-19H05345/）を加工して作成
DOI: 10.24517/00060242
Source: https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=53964&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=53964&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
Access Restrictions: 限定公開
Rights (production): CC BY-NC-ND
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Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 金沢大学 : 金沢大学学術情報リポジトリKURA