大腸癌で高頻度に認められる第18染色体短腕末端付近の特定アレル欠失の意義の解明

• Material Type: 文書・図像類
• Title: 大腸癌で高頻度に認められる第18染色体短腕末端付近の特定アレル欠失の意義の解明
• Author/Editor: 大村, 健二; Omura, Kenji
• Author Heading: 大村, 健二; Omura, Kenji
• Publication Date: 2005-04-18
• Publication Date (W3CDTF): 2005-04-18
• Alternative Title: Investigation of the significance of the loss of 18p which is frequently observed in colorectal cancer tissue
• Periodical title: 平成15(2003)年度 科学研究費補助金 基盤研究(B) 研究成果報告書概要 = 2003 Fiscal Year Final Research Report Summary
• No. or year of volume/issue: 2002-2003
• Volume: 2002-2003
• Pages: 2p.-
• Text Language Code: jpn
• Subject Heading: 大腸癌; 第18番染色体; loss of heterozygosity; allelic loss; microsatellite marler; チミジル酸合成酵素; polymerase chain reaction; 遺伝子多形性; colorectal cancer; chromosome 18; microsatellite marker; thymidylate synthase; gene polymorphism
• Target Audience: 一般
• Note (General): 金沢大学医学部附属病院; We examined the loss of heterozygosity of chromosome 18p in 177 normal colonic mucosa and corresponding colorectal cancer tissue by PCR using microsatellite markers D18S59,D18S476,D18S481,D18S52,D18S452 and D18S57. Furthermore, the number of the tandem repeat sequences existing in the non-translational region of the TS mRNA was determined by the PCR under the conditions described elsewhere. Of 172 normal colonic mucosa, 90 showed the TS genotype of double repeat(2R)/triple repeat(3R). The 18p allelic loss, including TS locus, was observed 58 samples corresponding to the 90 normal mucosa of 2R/3R TS genotype. The frequency of the loss of TS locus was 30%(12/40) for 2R/loss, and 48%(19/40) for 3R/loss. The frequency of allelic loss including TS locus is comparable for the cancer tissues with 2R/2R or 3R/3R. Consequently, the TS genotype should not affect the LOH of 18p including TS locus. The extent of the loss of 18p in colorectal cancer tissue estimated using 7 kinds of microsatellite markers was very wide. It was quite difficult to find new gene(s) contributing to the carcinogenesis of colorectal cancer. The allelic loss did not affect the expression of TS mRNA or TS protein, regardless the extent of the loss of 18p. The expression of TS protein was significantly high in the colorectal cancer tissue which had TS gene with 3R. It seemed that the expression of TS mRNA significantly contributed to the high expression of TS prortein.; 正常大腸粘膜とそれに対応する大腸癌組織合計177サンプルから得たcDNAを対象とした。TS遺伝子が存在する第18番染色体短腕(18p)のmicrosatellite markerであるD18S59、D18S476、D18S481、D18S52、D18S452およびD18S57を用いたPCRを施行し、大腸癌組織における18pの欠失範囲を観察した。さらに、TS遺伝子の非翻訳領域に存在する繰返し配列(TRS)を挟むprimersを用いたPCRで、TRS数によるTS遺伝子型を判定した。その結果、172サンプル中正常大腸粘膜のTS遺伝子型が2R/3Rのヘテロであった90サンプルに対応する大腸癌組織のうち58サンプル(64.4%)にTS遺伝子座を含むアレルの欠失が確認された。また、TS遺伝子座を含む内訳は、2R/lossが12サンプル(30%)、3R/Iossが19サンプル(48%)であった。正常大腸粘膜が3R/3Rもしくは2R/2Rのホモである大腸癌組織についても、TS遺伝子座を含むD18S59を用いた解析では、正常大腸粘膜が2R/2Rである大腸癌組織の2/4(50.0%)に、3R/3Rである大腸癌組織の47/78(60.3%)にTS遺伝子座を含むアレルの欠失が認められた、TS遺伝子型はLOHの頻度に影響を及ぼさないものと考えられた。次いで、D18S59以外の6種類の18pマーカーを使用し,18pの欠失範囲の判定を行なった。その結果、107サンプルに認められた18pの欠失はいずれも広観囲に及び、新規発癌責任遺伝子の特定は断念せざるを得なかった。一方、その範囲に関わらず、18pの欠失の有無はTSmRNAとTS蛋白の腫瘍組織内発現量に影響を及ぼさなかった。腫瘍組織内のTS蛋白発現量は、3Rのアレルが存在する組織で有意に高く、3RのmRNAが転写されることによってTS蛋白の翻訳が亢進すると考えられた。; 研究課題/領域番号:14370381, 研究期間(年度):2002-2003; 出典：研究課題「大腸癌で高頻度に認められる第18染色体短腕末端付近の特定アレル欠失の意義の解明」課題番号14370381（KAKEN：科学研究費助成事業データベース（国立情報学研究所）） （https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-14370381/143703812003kenkyu_seika_hokoku_gaiyo/）を加工して作成
• DOI: 10.24517/00057334
• Source: https://kanazawa-u.repo.nii.ac.jp/?action=repository_action_common_download&item_id=51031&item_no=1&attribute_id=26&file_no=1
• Access Restrictions: 限定公開
• Rights (production): CC BY-NC-ND
• Related Material: https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=30194301; https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-14370381/; https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-14370381/143703812003kenkyu_seika_hokoku_gaiyo/
• Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）; https://irdb.nii.ac.jp
• Original Data Provider (Database): 金沢大学 : 金沢大学学術情報リポジトリKURA