フォトサーマル効果を利用した光化学的ＲＮＡ情報編集システムの開発

Material type: 文書・図像類

Author: 藤本, 健造

Publisher: -

Publication date: 2014-05-30

Material Format: Digital

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Note (General)：: シトシンからウラシルへの点変異の際の鍵反応と考えられる脱アミノ化をより緩和な生理的条件下で進行させるため、生理的条件下で、全て光操作のみで細胞内RNA 上のシトシンからウラシルへのピンポイント変異を制御する今までにない分子システムの開発を目指している。超高速光架橋剤であるシアノビニルカルバゾールを含...

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Material Type: 文書・図像類
Title: フォトサーマル効果を利用した光化学的ＲＮＡ情報編集システムの開発
Author/Editor: 藤本, 健造
Author Heading: 藤本, 健造
Publication Date: 2014-05-30
Publication Date (W3CDTF): 2014-05-30
Alternative Title: Development of Photochemical RNA Editing induced by Photothermal Effect
Periodical title: 科学研究費助成事業研究成果報告書
Pages: 1-6
Text Language Code: jpn
Subject Heading: 光架橋
RNA編集
Target Audience: 一般
Note (General): シトシンからウラシルへの点変異の際の鍵反応と考えられる脱アミノ化をより緩和な生理的条件下で進行させるため、生理的条件下で、全て光操作のみで細胞内RNA 上のシトシンからウラシルへのピンポイント変異を制御する今までにない分子システムの開発を目指している。超高速光架橋剤であるシアノビニルカルバゾールを含む人工核酸の可逆的なmRNAへの光架橋反応を利用する際に、細胞内にも存在する化学物質である各種ジアミン類を添加させることで、生理的条件下でも脱アミノ化が進行することを見出した。本成果を発展させることで、化学的な手法による細胞内での正確な分子操作がさらに期待される。 : To improve the deamination reaction of cytosine in the photocrosslinked DNA double strand, the effect of additives on the deamination reaction was evaluated. The results indicated that diamine derivatives can accelerate the reaction in a concentration dependent manner. diamine derivatives having more than four carbons distance between two amine groups clearly accelerate the photochemical C-U transition reaction. For spermidine, the acceleration effect was caused by the interaction between spermidine and DNA double strand, although the increase of pH scarcely contributed to the acceleration effect. As the mammalian cells contain millimolars of spermidine and spermine, the acceleration of photochemical C-U transition, that was demonstrated in this study, might occur in mammalian cells. This provides a new design of artificial oligonucleotide having higher photo-editing activity.
研究種目：基盤研究(B)
研究期間：2011～2013
課題番号：23350079
研究者番号：90293894
研究分野：核酸化学、生物有機化学、化学生物学
科研費の分科・細目：複合化学・生体関連化学
identifier:https://dspace.jaist.ac.jp/dspace/handle/10119/12186
Format (IMT): application/pdf
Source: https://dspace.jaist.ac.jp/dspace/bitstream/10119/12186/1/23350079seika.pdf
https://dspace.jaist.ac.jp/dspace/bitstream/10119/12186/1/23350079seika.pdf
Access Restrictions: 限定公開
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 北陸先端科学技術大学院大学 : JAIST学術研究成果リポジトリ