光架橋反応を用いた１９ＦーＮＭＲによる核酸類検出法の開発

Material type: 文書・図像類

Author: 藤本, 健造

Publisher: -

Publication date: 2017-06-01

Material Format: Digital

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Note (General)：: 19F NMRのケミカルシフトを用いた核酸類検出法は、生体バックグラウンドが皆無であり、高い生体透過性を有することから、生体内などの夾雑試料中での核酸検出法として注目されている。本研究では、夾雑試料中でもB/F分離可能な大きなケミカルシフトの変化（8.0 ppm）を誘起可能な新規核酸類検出法（19F...

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Material Type: 文書・図像類
Title: 光架橋反応を用いた１９ＦーＮＭＲによる核酸類検出法の開発
Author/Editor: 藤本, 健造
Author Heading: 藤本, 健造
Publication Date: 2017-06-01
Publication Date (W3CDTF): 2017-06-01
Alternative Title: Development about photochemical detection of nuceic acids by 19F-NMR
Periodical title: 科学研究費助成事業研究成果報告書
Pages: 1-4
Text Language Code: jpn
Subject Heading: １９FーNMR
核酸検出
ケミカルシフト
Target Audience: 一般
Note (General): 19F NMRのケミカルシフトを用いた核酸類検出法は、生体バックグラウンドが皆無であり、高い生体透過性を有することから、生体内などの夾雑試料中での核酸検出法として注目されている。本研究では、夾雑試料中でもB/F分離可能な大きなケミカルシフトの変化（8.0 ppm）を誘起可能な新規核酸類検出法（19F NMRを用いた核酸類検出法）を開発した。さらに、実際の生体内に存在する核酸濃度は低い為、増幅系を組み込んだ配列選択的な核酸類検出法を開発し、最終的にnmスケールの核酸類の検出にも成功した。：We demonstrated an approach for the chemical shift-based detection of nucleic acids based on CNVK (cyanovinylcarobazole) mediated DNA/RNA photo-cross-linking. The 19F NMR signal of TFT(trifluoromethyl thymidine) in a DNA duplex structure was dramatically shifted from -63.2 ppm to -71.2 ppm induced by photo-cross-linking. This larger chemical shift change induced by CNVK mediated DNA photo-cross-linking enables DNA and RNA detection without confounding effects due to the influence of neighboring bases. We have also successfully demonstrated that 10 nM miRNA can be detected in a sequence-specific manner based on miRNA amplification and chemical shift caused by the photo-cross-linking of CNVK and TFT in DNA and RNA.
基盤研究(B)（一般）
研究期間：2014～2016
課題番号：26288077
研究者番号：90293894
研究分野：核酸化学
identifier:https://dspace.jaist.ac.jp/dspace/handle/10119/14334
Format (IMT): application/pdf
Source: https://dspace.jaist.ac.jp/dspace/bitstream/10119/14334/1/26288077seika.pdf
https://dspace.jaist.ac.jp/dspace/bitstream/10119/14334/1/26288077seika.pdf
Access Restrictions: 限定公開
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 北陸先端科学技術大学院大学 : JAIST学術研究成果リポジトリ