並列タイトル等A Genome-wide screening of circadian transcripts using a novel poly(A) determination method
タイトル(掲載誌)平成23(2011)年度 科学研究費補助金 挑戦的萌芽研究 研究成果報告書 = 2011 Fiscal Year Final Research Report
一般注記金沢大学理工研究域生命理工学系
mRNAのポリA鎖長を決定する、PACHINCO(Poly(A) Capture by Hairpin ChimericOligonucleotide)-RT-PCR法を構築した。本年度は本方法を全自動型DNA分析用マイクロチップ電気泳動装置(Shimadzu社)に適用するための条件の最適化を実施した。その結果、poly(A-T)鎖を効率的に検出する泳動条件を決定し、さらに、自動電気泳動装置からの出力データを用いたpoly(A)鎖長分布解析プログラムを開発した。
We have developed a novel method to determine the length of poly(A) in eukaryotic mRNA, and designated as PACHINCO(Poly(A) Capture by Hairpin Chimeric Oligonucleotide)-RT-PCR. In this year, we optimized the application of the method to an automated microchip electrophoresis system(MultiNA, SHIMADZU), including the development of the distribution analysis algorithm of a variety of poly(A) length.
研究課題/領域番号:23651184, 研究期間(年度):2011
出典:研究課題「新規ポリA鎖長決定法を用いた概日リズムが見られるmRNAのゲノムワイド検索」課題番号23651184(KAKEN:科学研究費助成事業データベース(国立情報学研究所)) (https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-23651184/23651184seika/)を加工して作成
関連情報https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=00242115
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23651184/
https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-23651184/23651184seika/
連携機関・データベース国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース(IRDB)(機関リポジトリ)