同種造血幹細胞移植成績向上を目指したKIRハプロタイプ解析手法の確立

Material type: 文書・図像類

Author: 細道, 一善ほか

Publisher: -

Publication date: 2017-05-29

Material Format: Digital

Capacity, size, etc.: -

NDC: -

View All

Notes on use

Note (General)：: 金沢大学医薬保健研究域医学系NK細胞に発現し、HLAを認識する受容体であるKIRは個人ごとに各ハプロタイプのもつ活性型と抑制型のKIRの遺伝子数は異なる。本研究は同種造血幹細胞移植成績向上を目指し、次世代シーケンサーによる網羅的なHLAならびにKIR領域のリシーケンス法を確立することを目的とした。3...

Related materials as well as pre- and post-revision versions

https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=50420948

https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26430195/

https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-26430195/26430195seika/

Search by Bookstore

Holdings of Libraries in Japan

This page shows libraries in Japan other than the National Diet Library that hold the material.

List of Cooperating Institutions and Databases

Please contact your local library for information on how to use materials or whether it is possible to request materials from the holding libraries.

other

Kanazawa University Repository for Academic Resources
Digital
You can check the holdings of institutions and databases with which Institutional Repositories DataBase(IRDB)(Institutional Repository) is linked at the site of Institutional Repositories DataBase(IRDB)(Institutional Repository).
Kanazawa University Repository for Academic Resources

Search by Bookstore

Bibliographic Record

You can check the details of this material, its authority (keywords that refer to materials on the same subject, author's name, etc.), etc.

Digital

Material Type: 文書・図像類
Title: 同種造血幹細胞移植成績向上を目指したKIRハプロタイプ解析手法の確立
Author/Editor: 細道, 一善
Hosomichi, Kazuyoshi
Author Heading: 細道, 一善
Hosomichi, Kazuyoshi
Publication Date: 2017-05-29
Publication Date (W3CDTF): 2017-05-29
Alternative Title: High-throughput sequencing method of the KIR haplotype for clinical applications
Periodical title: 平成28(2016)年度科学研究費補助金基盤研究(C) 研究成果報告書 = 2016 Fiscal Year Final Research Report
No. or year of volume/issue: 2014-04-01 - 2017-03-31
Volume: 2014-04-01 - 2017-03-31
Pages: 6p.-
Text Language Code: jpn
Subject Heading: NGS
KIR
HLA
造血幹細胞移植
Target Audience: 一般
Note (General): 金沢大学医薬保健研究域医学系
NK細胞に発現し、HLAを認識する受容体であるKIRは個人ごとに各ハプロタイプのもつ活性型と抑制型のKIRの遺伝子数は異なる。本研究は同種造血幹細胞移植成績向上を目指し、次世代シーケンサーによる網羅的なHLAならびにKIR領域のリシーケンス法を確立することを目的とした。34のHLA遺伝子、17のKIR遺伝子の全長をカバーするオリゴプローブをカスタムデザインし、シーケンスキャプチャー法による網羅的な解析手法を確立した。また、データ解析手法として、データベースに基づくタイピング、コピー数多型および構造多型検出によるハプロタイプ構造解析、網羅的一塩基置換および挿入欠失検出、の３つ解析法を確立した。
Killer-cell immunoglobulin-like receptors (KIRs) expressing on natural killer (NK) cells are ligands of human leukocyte antigen (HLA) class I molecules. The number of KIR genes is different among KIR haplotypes, therefore each individual has a different number of inhibitory and activating KIR genes. Here, we established high-throughput sequencing method to identify the haplotype structure of HLA and KIR genes. The method for KIR and HLA typing was based on sequence capture method with custom oligo probes and MiSeq. Sequence reads from seventeen KIR genes could be aligned. The alignment result of KIR genes has distinct depth indicating copy number variation (CNV). The single nucleotide variants were used to estimate KIR allele sequence. Combination of CNV and SNVs as KIR allele could be available to estimate KIR haplotype structure.
研究課題/領域番号:26430195, 研究期間(年度):2014-04-01 - 2017-03-31
DOI: 10.24517/00051762
Access Restrictions: 限定公開
Related Material: https://kaken.nii.ac.jp/search/?qm=50420948
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26430195/
https://kaken.nii.ac.jp/report/KAKENHI-PROJECT-26430195/26430195seika/
Data Provider (Database): 国立情報学研究所 : 学術機関リポジトリデータベース（IRDB）（機関リポジトリ）
https://irdb.nii.ac.jp
Original Data Provider (Database): 金沢大学 : 金沢大学学術情報リポジトリKURA