機関・団体別コレクション
- イギリス出版協会寄贈図書
- ロックフェラー財団寄贈図書
- 旧幕府引継書
- 京都円光寺旧蔵書
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」館守毎日記作成者一覧
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目1（1）館守毎日記. 第22代から第40代
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目1（1）館守毎日記. 第41代から第60代
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目1（1）館守毎日記. 第61代から第80代
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目1（1）館守毎日記. 第81代から第104代
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目1（2）『旧事編集』
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目1（3）『惣目録』
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目1（4）『分類事考』
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目2裁判記録関係その1
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目2裁判記録関係その2
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目3（1）児名送使（2）漂着使（3）告還使
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目3（4）吊礼使・吊慰使（5）告喪使
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目3（6）告訃使（7）退休使・給仮使・体情使
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目4（1）『両国往復書謄』その1
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目4（1）『両国往復書謄』その2
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目4（2）書式・目録
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目4（3）跡留
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目5倭館改修記録
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目6貿易関係記録
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目7『分類紀事大綱』
- 国立国会図書館所蔵「宗家文書」細目8そのほか
- 支那文庫（藤山文庫）
- 帝国図書館蔵ドイツ寄贈図書
- 読書週間記念文庫
- 満鉄本